最近Nature Method 发表了一篇很有意思的文章,讲述了一个基于Visium改进型的空间转录组,文章借用了Mechanical expansion microscopy 的方法。 大概就是将组织包埋于一种类似于PAGE胶中, 让后让其吸水膨胀,进而使组织无损扩展, 然后将扩展后的组织在进行Visium 空间组测序。
具体原理如下图:
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文章详见: https://www.nature.com/articles/s41592-023-01911-1
个人感觉这个是个很有用的创新,可以是分辨率提高2.5倍,从文中的数据看,确实扩张后的组织有更好的分辨率, 似乎基于测序的单细胞分辨率(或者更高分辨率)的空间转录组已经近在眼前了。