mRNA疫苗和灭活疫苗都是将细菌、病毒等病原微生物及其代谢产物，经过特殊制备方法制成的用于预防疾病的自动免疫制剂，二者在制备工艺、作用原理等方面存在一定的差异：
1、制备工艺：mRNA疫苗是将细菌、病毒等病原微生物及其代谢产物的DNA经转基因方式转录为mRNA，在体外进行相关修饰；灭活疫苗是使用经人工化学或物理等方法灭活病原微生物制成的疫苗，又称死疫苗；
2、作用原理：mRNA疫苗将病原微生物RNA在体外进行相关修饰，再传递到机体细胞内表达，使机体产生蛋白抗原，从而使机体产生针对该抗原的免疫应答，增强机体对此类病原微生物的免疫能力；灭活疫苗中的病原微生物在机体内失去繁殖能力，不会致病，但可以刺激机体产生特异抗体或致敏T淋巴细胞，从而产生免疫能力；
3、效果评价：mRNA疫苗在生理条件下不稳定，易降解，制备工艺较复杂，有效率相对较高，新冠mRNA疫苗目前已经在WHO授权下获批使用。灭活疫苗安全、易于保存、副作用较小，可以制成联合疫苗，如伤寒和副伤寒甲、乙混合的三联疫苗。
- mRNA疫苗和灭活疫苗区别
mRNA疫苗和灭活疫苗是常用的两种不同制备方式的疫苗。针对新冠病毒mRNA疫苗和灭活疫苗的防护效果，两者对新冠病毒都有比较良好的预防作用，而且可以有效预防重症感染的发生，但目前由于缺乏时间和数据的证据，无法进行二者防护效果对比。
灭活疫苗是通过注射失去活性的病毒触发人体免疫反应达到主动免疫的效果，由于是失去活性的病毒，虽然保留了抗原性，但并不会引发疾病感染。就新冠病毒灭活疫苗和mRNA疫苗对比，据医学统计，灭活疫苗不良反应率更低，但灭活疫苗产生的免疫强度不一定足够，一般需要多次接种才能获得足够的保护力抗体。
mRNA疫苗又称核酸疫苗，是将含有特定基因序列的载体导入宿主体内，表达出抗原蛋白触发人体免疫。mRNA疫苗的优点在于制备速度快，缺点在于mRNA不稳定，对疫苗运输和储存要求较高。
