国学大师陈寅恪先生在《明季滇黔佛教考·序》言道：“明社既屋，其地之学人端士，相率遁逃于禅。”
明清交替，社会动荡，国破家亡，许多文学世家也不免卷入其中 。在满夷的铁蹄践踏文章锦绣之乡的时候，吴江一地有不少节烈的文人或从义军抗清，或遁入空门。而叶绍袁选择了后者。在母亲冯氏，女儿小鸾、纨纨和妻子宛君相继离世后，叶绍袁携三子到杭州遁入了空门，取法名木弗。后来又投平湖外婆家栖居，在此期间，留下了八卷《甲行日注》。 《甲行日注》寥寥数语，字字皆血，写尽人间悲欢，令人不忍卒读。日记从1645年记录到1648年，这是叶绍袁生命的最后四年。1648年9月25日， 日记戛然而止。同月27日，也就是两天后，叶绍袁在贫病、忧愤中逝去,享年60岁 。
岳麓书社再版的本子依旧由毕敏校注，并收入了窃闻，续窃闻等篇章。1986年，毕敏先生点校《甲行日注》时，点校的底本是《嘉业堂丛书》，参考了道光间《荆驼逸史》本 （ 出家为僧的叶绍袁署名木拂纂），光绪间石印本， 1936年（民国25年）沪上刊行的《中国文学珍本丛书》，旧版除了周作人的原序，亦收入相关的“ 外三种”即窃闻、续窃闻、亡室沈安人传 ，又在外三种外附录了其妻子所作悼念爱女的《季女琼章传》（潘云告点校）。岳麓书社的总编辑钟叔河在1986年的点校本序中说:"《甲行日注》表现的是“国恨”，这外三种表现的则是“家愁”。"1986年的本子，已经绝版，《午梦堂集》（《甲行日注》附录在其中 ）的新版和旧版皆价格不菲。《甲行日注》单行本的再版，让后人更多地了解叶绍袁，乃至整个吴江叶氏、沈氏文学世家，应当是一件幸事。
