热图结构，介绍及热图中的名词含义

占位中。。。。。。

热图，Heatmap，其实是几乎所有与数值有关的领域都有可能用上的一个数据可视化实现。在生物信息数据分析中，或者说其实生物学实验中Qpcr的结果上，热图有太多。
关于热图的绘制，有太多的方法

在paper中常常能看到热图（heatmap）：“形式为功能服务”。在我们常见的，使用矩阵作为Input的二维热图中，多为基因表达差异，16s分析中不同分组的物种丰度/相对丰度差异提供线索及可视化效果。
使用热图可以直观通过颜色的深浅和差异判断样本/组别之间的差异。结合统计检验的显著性结果，可以评估出显著性的方向。热图可以通过算法生成系统树，表现各个subject及feature的聚类关系。
在R中可以使用gplots包中的heatmap.2轻松画出热图。但对于其scale, 系统树的建立，以及很细节的字体大小，图片大小，color key的数值范围设置，对应的颜色设置等，均需要通过参数的调整实现。虽然比起其他编程工具，R是个封装很严实的软件，这意味着许多参数不能很灵活的去修改。但这不妨碍我们充分使用它带来的便利。

最后编辑于 ：
©著作权归作者所有,转载或内容合作请联系作者
平台声明：文章内容（如有图片或视频亦包括在内）由作者上传并发布，文章内容仅代表作者本人观点，简书系信息发布平台，仅提供信息存储服务。

推荐阅读更多精彩内容

  • 阿衮-运营作业3
    一、流程图 二、改进意见 1、为建立完整生态，可布局高校社群，宣传渠道扩大，能更有针对性的向目标群体推广。同时也可...
    阿衮阅读 230评论 0赞 2
  • 一个出差狗的经验总结(一）
    你是否遇到以下场景？明天早上就要出差，半夜11点还在整理物品，担心丢三落四漂亮的行李箱空间有限，什么都想装，携带物...
    张超超超阅读 4,089评论 14赞 35
  • 随想记（三）
    容纳 路上听齐柏林飞艇 滚石杂志评比：最伟大的鼓手第2名最伟大的吉他手第9名最伟大的歌手第15名仅从世俗的标签看就...
    Zerohated阅读 373评论 0赞 0
  • 2017-10-09
    缘分这件事，错过了就错过了，后悔也没用，虽然现在我挺喜欢他的。 我觉得，错失了机会，就错失了。不能做那个突破道德底...
    没有名字阿阅读 152评论 0赞 0