给自己的记录，方便下次查阅！
测了一些ChIP-seq的数据，除了拿到公司的套路分析结果以外，想要做一点自己想要的分析，但是有没有基础，上了生信技能树的入门课，然后就在网上各种折腾，不过始终还是小白，缺乏练习。
最大的感悟呢，就是试试才知道~哈哈y
一、解决系统问题
作为一个Windows 骨灰使用者，Linux仅限于半天的了解。
虽然深知要掌握一个技能不是一天半天能够练就的，但是急于解决眼前的问题，也不可能慢慢一步一步来了，所以先把主线找出来，然后在这个过程中也能慢慢熟悉，不然总觉得缺乏动力。
考虑了虚拟机和云服务器来解决系统问题，由于担心电脑配置和技术上的问题，选择了腾讯云服务器。
流程参考了网上一个博客文章，链接如下
https://blog.csdn.net/genecollege/article/details/93229655
配置是这样：1核 2GB 1Mbps
操作系统:ubuntu
PS：这个级别基本上只能做练习。
2、从本地链接的云服务器
使用的是Xshell软件
文件-新建
账号密码输入后成功链接
3.权限问题
经常一些操作出现权限限制，又去网上找了半天，觉得比较好的解决方法如下（小白之见）：
在这个博客上找到的解决方法：https://blog.csdn.net/qq_35624030/article/details/79836347
1）输入命令
sudo passwd
根据提示输入两次新密码
2）输入命令
su root
3）命令前的 $ 号变成 # 号
4、准备工作
1) 我自己创建的一个文件夹，方便自己操作
命令：mkdir test
2)下载miniconda，流程都是从生信技能树学的，命令如下：
wget -c https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda2-latest-Linux-x86_64.sh
3)安装miniconda，命令如下：
bash Miniconda2-latest-Linux-x86_64.sh
按提示操作，没有出现新的用户行之前都是还没完成的，
出现“Thank you for installing Miniconda2!”说明安装成功了
用命令：
conda --help
检测是否安装成功。
4）配置镜像，命令如下：
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
conda config --set show_channel_urls yes
5）创建和激活小环境
conda create -n ChIP
conda install python=2
source activate ChIP
5、安装需要的软件
因为单纯的只是想先试试deeptools,所以命令如下：
conda install -y deeptools
Mark一下：后续可能还要装其他的软件，就是把上面的这个deeptools 换成其他软件的名字就可以了。关键在与这个软件的名字要与bioconda镜像中的软件名一模一样才行。。
