研究发现孕母高龄、感冒或发烧、孕早期用药、被动吸烟、不良生育史、接触噪声、受到辐射、居室新装修、孕期糖尿病、饲养宠物等，是新生儿CHD的危险因素。应预防为主，做好三级预防工作。开展社会宣传和健康教育，将先天性心脏病等出生缺陷的严重危害和预防措施等科学知识列入教学内容，并作为群众健康教育的重点内容。
将预防工作提前到婚前、孕前，建造良好的妊娠环境，杜绝父母亲的不良嗜好，在妊娠期避免有毒有害物质的侵袭，减少先天性心脏病的发生。
做好一级预防，要严格按照围产保健服务程序及服务内容提供服务，切实做好高危妊娠（有先心病史、糖尿病、怀孕年龄大于35岁、孕早期接触过有毒化学物质和曾经患感染性疾病等）的筛查、指导、追踪、随访工作，加强孕期营养宣教工作。
做好二级预防，需要规范产前医学检查（高危孕妇胎儿超声心动图检查）的服务项目，通过科学培训提高先天性心脏病的B超宫内诊断水平。
做好三级预防，需要加强新生儿保健，规范新生儿体检，对先天性心脏病儿及早进行手术治疗。
最后做好健康宣教，对患儿的父母给予持续的家庭宣教，防止过度保护患儿，让家庭成为提高患儿生命质量的重要支持力量，在婴儿期成功矫正的复杂先心病儿童，大部分可以与同龄健康儿童一样，参加所有正常的年龄适当的体力活动，家长不应过多地限制患儿的活动。
