泛素酶:泛素化研究的基石,PROTAC开发的核心

泛素酶与PROTAC

蛋白质作为生命活动的主要承担者,在完成使命后需要及时启动降解和清除。如果在这个过程中出现问题,就会引发一系列疾病,最典型的当属神经退行性疾病,如阿尔茨海默症、帕金森、亨廷顿病等。

人体细胞降解蛋白质的主要途径有泛素-蛋白酶体系统(UPS)和溶酶体-自噬通路。PROTAC是一种新兴治疗方式,利用UPS选择性的靶向降解疾病相关的蛋白质,调节小分子药物难靶向的“不可成药”靶点。因此,PROTAC概念自2001年首次报道以来,受到科研界和药企的广泛关注。

SignalChem Biotech(义翘神州全资子公司)凭借20多年为泛素研究提供高活性重组酶蛋白和底物的经验,已成功开发泛素、E1泛素激活酶、E2泛素结合酶、E3泛素连接酶、去泛素化酶等一系列产品。


“一键三连”泛素化

研究发现80%-90%的蛋白质降解由泛素-蛋白酶体系统(UPS)介导完成。

UPS俨然是人体的一个蛋白质“垃圾处理站”。泛素“一键锁定”靶蛋白,标记为待处理的垃圾,即“泛素化”。通过E1泛素激活酶、E2泛素结合酶、E3泛素连接酶实现“三连击”,将靶蛋白进行集中处理,接收信号并降解靶蛋白。

泛素-蛋白酶体系统(源自文献:doi: 10.1038/s41568-021-00365-x)



泛素,因其广泛存在于真核生物的各类细胞中而得名。泛素在人类基因组中有4个基因编码:UBB、UBC、UBA52和RPS27A。其中RPS27A和UBA52编码单拷贝的泛素,与核糖体蛋白L40和S27a形成融合蛋白。UBB和UBC则表达多拷贝泛素前体。成熟的泛素有76个氨基酸且高度保守,其中甲硫氨酸和赖氨酸对于泛素链形成尤为重要。

泛素酶的接力:E1泛素激活酶催化泛素并通过巯酯键结合在一起,随后E2泛素结合酶通过巯基置换,取代E1,将泛素结合到E2上。泛素化的E2蛋白和E3泛素连接酶以及底物形成复合体。在E3的催化作用下,将泛素的羧基末端与靶蛋白赖氨酸残基间形成氨基异肽键,从而将泛素转移到靶蛋白上。最后通过26S蛋白酶体降解泛素化标记的蛋白质。


泛素化过程中的关键酶

E1泛素激活酶

E1进化上保守,属于ATP依赖酶,通过与泛素C端形成高能硫脂键而激活泛素。在结构上E1可以被分为4个功能区:腺苷化结构区(催化ATP与泛素形成泛素腺苷酸中间体)、半胱氨酸催化区(催化泛素和半胱氨酸形成巯酯键)、4HB(维持E1结构)、泛素折叠区(招募特异性的E2蛋白)。在人体中E1泛素激活酶除了UBA1和UBA6,还有其它结构类似的蛋白,同样具有E1激活酶的作用,如UBA2、UBA3、UBA4、UBA7等。

E2泛素结合酶

大约有40余种,在结构上具有UBC结构域,还有3个loop环,loop1和loop2是E3酶的结合区,loop3含有半胱氨酸,是泛素结合区。E2突变与疾病发生相关,如UBE2D2/3、UBE2L3、UBE2N和UBE2R1与帕金森症密切相关,UBE2L3和类风湿关节炎等自身免疫病相关,UBE2C、UBE2D与不同肿瘤发生机制相关。

E3泛素连接酶

目前已超过600多种。按照结构可以分为3类:RING E3、HETC E3和RBR E3连接酶。E3连接酶和底物直接相关,在体内生物学功能中发挥重要作用。E3连接酶的突变与多种疾病相关,如MDM2通过影响p53的稳定性调控癌症进展。Parkin功能缺失导致线粒体外膜蛋白无法正常代谢,进而引发帕金森病。E3连接酶BRCA1是乳腺癌的标志物之一。

PROTAC:让泛素化实现临床转化

泛素化调节蛋白质的稳定性、功能、亚细胞定位及相互作用,广泛参与免疫反应调控、DNA损伤修复、细胞周期调控、细胞增殖凋亡等几乎所有的生命活动。一旦失调将可能引发癌症、免疫疾病、神经退行性疾病、代谢综合征等病变。

靶向蛋白降解嵌合体(PROTAC)利用细胞的天然泛素-蛋白酶体系统,选择性地降解致病蛋白质,调节传统小分子难以靶向的“不可成药”蛋白。

PROTAC通过两个连接子(Linker)连接的配体形成异双功能小分子降解剂,一端负责结合目的蛋白(POI),另一端招募并结合E3泛素连接酶。PROTAC同时结合目的蛋白和连接酶,形成E3-降解剂-POI三元复合物诱导目的蛋白泛素化,并随后被26S蛋白酶体降解,进而实现抑制肿瘤生长的目标。整个过程中PROTAC分子可以重复回收利用,靶向目的蛋白。


PROTAC结构示意图(源自文献:doi: 10.1016/j.csbj.2023.02.042)

设计有效的PROTAC关键是选择对E3连接酶亲和力足够高的E3配体,且在不影响其泛素化活性的情况下招募功能活跃的E3连接酶。目前PROTAC广泛使用CRBN和VHL两种E3连接酶。新的PROTAC适用E3连接酶也在发现和开发中,如DCAF2、TRIM、KLHL、RNF等。

可用于PROTAC专用的E3连接酶(源自文献:doi: 10.1038/s41573-021-00371-6)

领先的泛素解决方案

SignalChem Biotech(义翘神州全资子公司)凭借20多年为泛素研究提供高活性重组酶蛋白和底物的经验,持续助力您的研究

- 如果您需要靶向蛋白降解(TPD或PROTAC)研究的帮助,我们提供高活性的E3泛素连接酶,如CRBN、VHL、RNF34及Cereblon/DDB1/Cul4A/Rbx1复合体等。

- 我们还提供高活性的E1泛素激活酶、E2泛素结合酶、去泛素化酶和泛素及泛素样蛋白。

- 如果您对阿尔茨海默病、帕金森病或ALS研究感兴趣,我们有重组Tau蛋白及磷酸化抗体、α-Synuclein、TDP-43等高活性重组蛋白。

总之,SignalChem Biotech拥有市面上种类齐全的泛素研究相关产品,包括泛素、泛素酶、去泛素化酶、蛋白酶体、泛素样蛋白及底物。

免责声明:义翘神州内容团队仅是分享和解读公开的研究论文及其发现,专注于介绍全球生物医药研究新进展。本文仅作信息交流用,文中观点不代表义翘神州立场。随着对疾病机制研究的深入,新的实验结果或结论可能会修改或推翻文中的描述,还请大家理解。

本文不属于治疗方案推荐,如需获得治疗方案指导,请前往正规医院就诊。

【参考文献】

[if !supportLists]1. [endif] Brandon Dale, et al. Advancing targeted protein degradation for cancer therapy. Nature Reviews Cancer, https://doi.org/10.1038/s41568-021-00365-x

2. Tin M. Tunjic, Noah Weber, Michael Brunsteiner. Computer aided drug design in the development of proteolysis targeting chimeras. Computational and Structural Biotechnology Journal, https://doi.org/10.1016/j.csbj.2023.02.0423. Miklós Békés, David R. Langley and Craig M. Crews. PROTAC targeted protein degraders: the past is prologue. Nature Reviews Drug Discovery, https://doi.org/10.1038/s41573-021-00371-6

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