文献分享(1)|S63845:肿瘤研究中的高效MCL抑制剂/细胞凋亡概述

1.细胞凋亡的概念

细胞凋亡是细胞的一种基本生物学现象,在多细胞生物去除不需要的或异常的细胞中起着必要的作用。正常的细胞凋亡是在一系列基因的激活、表达以及调控下有序进行的,机体无炎症反应,且对整个机体的发育是有利和必须的。但肿瘤细胞中,凋亡过程是被抑制的,导致肿瘤细胞无限制地生长、繁殖。通过对多种癌症的研究表明,MCL-1蛋白的过度堆积,可能是肿瘤细胞细胞凋亡进程被抑制的重要原因

细胞凋亡过程的模式图

2.S63845简介

MCL-1蛋白属于抑制细胞凋亡的BCL-2分子家族,它存在于众多肿瘤中。之前从未有过该蛋白的抑制剂被合成,而此次发现的S63845填补了这一项空白。S63845以高亲和力特异性结合MCL-1的BH3结合槽,通过激活BAX/BAK依赖性线粒体凋亡途径,高效地杀死MCL-1依赖性癌细胞,其中包括多发性骨髓瘤,白血病和淋巴瘤细胞。

S63845的结构式

在发现这一分子后,实验人员在免疫受损小鼠体内移植了多发性骨髓瘤细胞H929和AMO1,之后静脉注射S63845,得到的结果令人振奋:S63845在H929模型中最大的肿瘤生长抑制为103%,在AMO1模型中最大的肿瘤生长抑制为114%,并且在AMO1模型中,S63845注射剂量在25 mg/kg时,8只小鼠通过一百天治疗有7只小鼠的肿瘤完全消退。

通过进一步的研究表明,这一MCL-1蛋白的抑制剂在单独或与其他抗癌药物组合使用时,对一些固态肿瘤细胞系也同样有效。更加令人惊喜的是:在药物作用的有效剂量下,正常细胞对S63845完全耐受,未来的病人在合理使用S63845时,很可能不需要忍受副作用的痛苦。因此,S63845小分子的发现,意味着“广谱抗癌药物”成为了可能。它或将帮助制药企业开发出针对多种癌症的新型药物。

3.凋亡通路核心分子家族成员介绍

(1)Bcl-2家族

Bcl-2家族最有代表性的家族成员就是Bcl-2分子。Bcl-2分子内含有四个同源结构域,分别是BH1-BH4。家族成员根据分子内所含有的同源结构域的差异,可以分为三个不同的亚家族:

1)Bcl-2亚家族

Bcl2、Bcl-xL、Mcl-1等属于这个亚家族的成员,几乎都含有BH1和BH2结构域。Bcl-2亚家族成员对细胞凋亡起到抑制的作用。

2)Bax亚家族

Bax亚家族都含有BH3结构域,但是除了BH3结构域之外,也含有其他的BH结构域。Bax亚家族成员所起到的作用和Bcl-2亚家族成员的功能正好相反,它们起到促进细胞凋亡的作用。包括Bax和Bak。

3)BH3亚家族

这个亚家族内的成员,只含有BH3结构域。它们的作用也是促进细胞凋亡。也称为凋亡引发亚族(apoptosis initiator group),由仅含BH3结构域的蛋白质组成,包括Bad、Bid、Bim、Puma和Noxa。因为BH3结构域的存在,此类蛋白可以与前两类Bcl2家族的蛋白互作,从而起到促凋亡的作用。

在Bcl-2家族内,最明星的两个分子是Bcl-2分子和Bax分子。在没有凋亡应激的情况下,抑凋亡蛋白Bcl-2或Bcl-xL与促凋亡蛋白Bax或Bak形成异二聚体,抑制Bax/Bad的促凋亡活性,以维持线粒体外膜完整性并阻断线粒体凋亡。所以细胞内Bcl-2/Bax的比例对决定细胞凋亡的敏感性起到重要作用。当细胞内Bax高表达时,细胞对死亡信号敏感,促进了细胞发生凋亡。当Bcl-2高表达时,Bcl-2可以和Bax形成异源二聚体,抑制细胞凋亡。

在存在凋亡刺激的情况下,促凋亡蛋白Bax表达增加,或者仅含BH3结构域的蛋白(例如Bad,Bid,Bim)的表达增加,随后它们竞争性结合抑凋亡蛋白Bcl-2以释放Bax/Bak免受抑制。游离Bax和Bak形成寡聚体,导致细胞色素C通过在线粒体外膜中形成一个通道,从线粒体的膜间空间释放到细胞质。释放的细胞色素C激活Caspase级联反应来诱导细胞凋亡。

如果你观察kegg图中线粒体的周边,Bid蛋白有几种形式,分别是tBid(truncated Bid )、gtBid(granzyme B truncated Bid)、jBid(JNK-mediated cleaved Bid),这对应不同来源的Bid蛋白切割产物。下面我们先了解下这3种产物的形成来源。

(1)tBid:Bid可以被Caspase 8切割为截短的产物tBid。全长Bid位于胞质溶胶中时,截短的tBid转移到线粒体,进一步触发下游的线粒体凋亡通路。Bid是Caspase 8诱导线粒体损伤的介质,从而将凋亡信号从细胞质膜传导至线粒体;

(2)gtBid:Bid的另外一种产物gtBid涉及细胞毒性T淋巴细胞(CTLs)对靶细胞的破坏机制。颗粒酶B(granzyme B /GZMB)可以对Bid进行水解切割,以产生转移到线粒体的截短产物(gtBid);

(3)jBid:活化的JNK(MAPK通路的重要成员)可以介导Caspase 8非依赖性的Bid切割,产生jBid。jBid会激活与tBid、gtBid不同的下游通路,激活细胞凋亡。

Bcl-2家族的分类和结构示意图

(2)Caspase家族

Caspase家族是一组蛋白酶,介导即将死亡的细胞高效且特异的蛋白水解作用,是细胞凋亡过程中非常重要的效应分子。Caspase蛋白水解酶有三个特征:1)都是半胱氨酸蛋白酶;2)作用位点都在天冬氨酸残基后的位点;3)Caspase家族成员都是以酶原的形式存在,需要经过活化。

Caspase家族成员,可以按照功能分为三组:

1)凋亡启动亚类Caspase蛋白酶(apoptoticinitiation)

这一类Caspase包括Caspase-2、8、9和10。它们是细胞凋亡的起始分子。

2)凋亡效应亚类Caspase蛋白酶(apoptoticexecution)

这一类Caspase包括Caspase-3、6和7。它们是具体执行细胞凋亡的效应分子。因此凋亡效应类的Caspase蛋白酶在信号传导的过程中始终处于凋亡启动类Caspase蛋白酶的下游。

3)细胞因子激活类Caspase蛋白酶(cytokineactivation)

这一类Caspase包括Caspase-1、4、5和13。这一类Caspase分子与细胞凋亡的关系不是很密切,可能与多种炎症因子或者细胞因子的成熟有关。

(3)细胞色素C(Cyt C)

细胞色素C在线粒体凋亡过程中处于中心地位。Cyt C是生命体中一种重要的水溶性氧化还原血红蛋白,由一条肽链包裹一个血红素组成。正常情况下,CytC存在于线粒体内膜上,行使生命体氧化还原反应电子传递链中的一个环节。细胞凋亡信号的刺激使Cyt C从线粒体内释放到细胞质,并与细胞凋亡激活因子1(Apaf-1)结合形成凋亡复合体,活化Caspase 9前体,进而激活Caspase 3和Caspase 7,引发Caspase级联反应,从而诱发细胞凋亡。

(4)P53蛋白

P53大家听的比较多。P53是一种转录因子,可以促进一系列促凋亡基因的表达,因此P53是一个典型的抑癌基因。野生型P53诱导细胞凋亡的途径包括:

(1)调节细胞周期蛋白。在DNA损伤信号刺激下,P53可以促进p21-Cip1表达,从而抑制CDK2的活性,从而阻止细胞进入DNA合成期,停滞于G1期,进而介导细胞发生凋亡。

(2)通过增加促凋亡蛋白Bax、Bak等的转录表达,从而抑制Bcl-2的活性,促进细胞凋亡。

4.介导凋亡的通路

介导凋亡的通路有三条:分别是线粒体通路;内质网通路和死亡受体通路。

(1)线粒体通路

线粒体被认为是处于凋亡调控的中心位置。在线粒体通路中,死亡信号激活含BH3结构域的Bcl-2家族成员,例如Bax。这些含BH3结构域的Bcl-2家族成员(例如Bax)发生寡聚化,并插入线粒体膜,引起线粒体膜通透性改变,跨膜电位丢失,释放细胞色素C(CytC)和其他蛋白。

CytC的释放是线粒体凋亡路径的关键限速步骤。CytC与凋亡蛋白酶活化因子(apoptoticprotease-activatingfactor,Apaf-1)形成多聚复合体,通过Apaf-1氨基端的Caspase募集结构域(caspaserecruitmentdomain,CARD),募集胞质中的Caspase-9前体,并使其自我剪切活化,然后启动Caspase级联反应,激活下游的Caspase-3和Caspase-7,完成其相应底物的剪切,引起细胞凋亡。

线粒体是细胞能量代谢的中心。细胞凋亡过程中,对线粒体损伤后最直接的结果是线粒体正常功能的丧失。线粒体功能障碍,除了会直接诱导细胞凋亡外,还会导致自由基产生增加、兴奋性氨基酸释放增多、钙离子超载等现象。如果细胞的损伤程度相对较轻,ATP能提供细胞凋亡所需的能量,则发生细胞凋亡;若细胞的损伤程度较为严重,ATP急剧耗竭,则细胞发生坏死现象。

线粒体通路


(2)内质网通路

内质网是细胞内蛋白质合成的主要场所,同时也是Ca2+的主要储存库。内质网在维持细胞内钙离子的稳定以及膜蛋白的合成、修饰和折叠等方面都发挥关键性作用。当内质网内,钙离子平衡被破坏或者内质网蛋白的过量积累,都会诱导Caspase-12在内质网膜上的表达,同时内质网也介导了胞质的Caspase-7转移到内质网表面并激活Caspase-12。激活后的Caspase-12可进一步剪切Caspase-3,引发细胞凋亡。内质网的功能失调在某种程度上可以影响线粒体通路的凋亡现象。许多细胞在凋亡早期,由于内质网中Ca2+的释放,会导致胞质内Ca2+浓度迅速且持续的升高。高浓度的Ca2+可以激活胞质中的钙依赖性蛋白酶,又可以作用于线粒体,影响线粒体的通透性并导致线粒体膜电位的改变,从而促进凋亡。

内质网通路

(3)死亡受体通路

胞外的死亡信号可通过死亡受体转入胞内。死亡受体为一类跨膜蛋白,属于肿瘤坏死因子受体(TNFR)基因超家族。它们胞外部分都含有一个富含半胱氨酸的区域,胞质区有一个由同源氨基酸残基构成的结构。这个结构具有蛋白水解功能,被称为“死亡结构域”(deathdomain,DD),可使死亡信号得以进一步传递,最终启动凋亡。

已知的死亡受体有五种:1)TNFR-1(又称CD120a或p55);2)Fas(又称为CD95或Apo1);3)DR3(死亡受体3deathreceptor3,又称Apo3);4)DR4(死亡受体4,又被称为TRAIL-R1);5)DR5(死亡受体5,又被称为Apo2,TRAIL-R2)。

与死亡受体相互对应的就是死亡配体(ligand)。与TNFR对应的死亡配体是TNF(肿瘤坏死因子);和Fas对应的死亡配体是FasL(CD95L);和DR3对应的死亡配体是Apo-3L(DR3L);和DR4以及DR5对应的死亡配体是Apo-2L(TRAIL)。

死亡受体通路

Fas/FasL通路和 TNF/TNFR通路在其中最为重要。

5.凋亡的检测方法

(1)形态学

光学显微镜下细胞缩小、核浓缩、细胞周围出现透明圈等现象。相差显微镜下细胞鼓泡,凋亡小体的产生等现象。透射电镜观察到细胞表面微绒毛的消失、核染色质沿核膜分布、新月体形成及凋亡小体的形成等现象。

(2)流式细胞检测(Annexin V-PI双染色实验)

AnnexinV-PI双染色实验是用于检测凋亡的经典实验方法。

在正常细胞中,磷酯酰丝氨酸只分布在细胞膜的脂质双分子层的内侧。当细胞发生凋亡的早期阶段,磷酯酰丝氨酸从细胞膜内侧外翻到细胞膜的外侧。AnnexinV作为一种磷脂结合蛋白,与磷酯酰丝氨酸有高度亲和性。它通过细胞外侧暴露的磷酯酰丝氨酸与凋亡早期细胞的细胞膜结合。因此,AnnexinV是检测细胞早期凋亡的灵敏指标。PI是一种核染料,它不能透过完整的细胞膜。但是在凋亡的晚期阶段或者是细胞发生坏死现象,由于细胞膜的完整性已经遭到破坏,使得PI能够透过细胞膜与细胞核发生结合。因此,通过AnnexinV-PI双染色实验,再通过流式细胞仪进行检测,可以把细胞分为四种类型:

1)AnnexinV阴性且PI阴性(双阴性细胞),这类细胞是活细胞;

2)AnnexinV阳性且PI阴性,这类细胞是早期凋亡的细胞;

3)AnnexinV阳性且PI阳性(双阳性细胞),这类细胞是晚期凋亡或者是坏死的细胞;

4)AnnexinV阴性且PI阳性,这种情况可能是由于非特异性染色导致的。因为AnnexinV阴性,表示磷酯酰丝氨酸没有外翻,说明细胞膜依然具有完整性。PI不能透过完整性的细胞膜和细胞核结合,因此从理论上讲,不存在AnnexinV阴性而PI阳性的细胞。

Annexin V-PI双染色实验结果示意图

(3)核酸电泳检测细胞凋亡(DNA片段检测法)

当细胞发生凋亡时,小分子DNA片段不断增加,高分子DNA片段不断减少。凋亡细胞DNA断裂的特点是DNA断裂不是随机的,而是由于内源性的内切酶作用,因此DNA的断点都是规律性的发生在核小体之间,因此出现的DNA片段都是180-200bp的片段或者是180-200bp整数倍的DNA片段。在凝胶电泳中,如果出现这种特征性的电泳条带,就可以判断细胞发生了凋亡。

(4)凋亡明星分子检测

通常检测明星分子,采用的是Western Blot的方法检测蛋白。因此,结合线粒体通路,首先是检测激活的Cas-9。然后激活的Cas-9再级联放大激活下游的Cas-3,所以Cas-9和Cas-3几乎是逃不掉的两个明星分子。前体分子是Pro-cas-9和Pro-cas-3。在检测之前,大家需要好好看看抗体的说明书。因为有些抗体只识别前体Cas-9和前体Cas-3,有些抗体即能检测前体Cas-9和前体Cas-3,又能检测激活后的Cas-9和Cas-3。

另外,Cas-3激活后可以作用于很多的底物之上,最常检测的Cas-3的底物是PARP分子。另外,在凋亡发生时,Bcl-2家族成员发挥了重要的作用。例如,抑制凋亡的Bcl-2和促进凋亡的Bax。因此,常常通过western检测Bcl-2和Bax的表达量,通过Bcl-2/Bax的比值,表征细胞凋亡的程度。对于死亡受体介导的凋亡通路,Fas、FasL、TNF和TNFR,都是常规需要检测的明星分子。在FasL-Fas通路以及TNF-TNFR通路之下,都涉及到FADD分子。所以检测FADD也是非常常见的。但是,在TNF-TNFR通路之下,由于这条通路非常地复杂,具体问题具体分析即可。

参考文献:

[1] Letai A, et al. S63845, an MCL-1 Selective BH3 Mimetic: Another Arrow in Our Quiver. Cancer Cell. 2016 Dec 12;30(6):834-835.  

[2] Kotschy A, et al. The MCL1 inhibitor S63845 is tolerable and effective in diverse cancer models. Nature. 2016 Oct 27;538(7626):477-482.   作者:MCE抑制剂 https://www.bilibili.com/read/cv19069630 出处:bilibili

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