定义
基因组选择的最基本思路：在基因组中存在大量遗传标记(SNP)，影响性状的所有基因都至少与一个标记紧密连锁。因此通过对所有标记效应的估计，实现对全基因组所有基因效应的估计。利用估计的标记效应计算个体育种值，即基因组育种值(gEBV)，然后根据gEBV的大小(或结合系谱、后裔信息)进行选择。
流程：
- 1.建立参考群体
a.选择具有可靠育种值的验证公牛或母牛
b.用SNP芯片测定每个个体的SNP基因型 - 2.利用估计SNP效应的统计分析系统获得一套SNP效应估计值
- 3.建立估计gEBV的统计分析系统，预测候选个体的gEBV用于选种。
在选择群体中进行基因组选择的基本过程：
1.测定候选个体的SNP基因型
2.计算个体gEBV
3.依据gEBV结合其它信息进行遗传评定和排序
全基因组选择的优势
- 1.能够捕获所有的遗传变异
- 2.建立参考群估计出一套SNP效应值后，对于候选个体不依赖表型信息、
- 3.选择准确性更高(70%～90%)
- 4.可以早期选择(缩短世代间隔)
- 5.可准确评定一些难于测定或新定义的性状
- 6.降低育种成本
- 7.大幅度提高育种进展(20%～50%)。
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