装包是件苦差事（至少在你没有明确的思路以前）。
装包时，通常可以搜索一下包名，就能得到常规的安装命令以完成安装（这些命令通常位于github,bioconductor,cran之类的地方）。如果常规的安装命令无效，则可以考虑以下几种方案：
（友情提示，不管是哪种途径装包，装完都要library检验哦！）
1.网络问题（有timeout字样出现）-调整时间，更换镜像
调整时间，防止R自动中止下载：
options(timeout=100000)
更换镜像：
方法①：直接点击Rstudio界面的tools-global options-packages，这里会有一个包含mirror(镜像)字样的选项，更改至国内的镜像即可。
方法②：代码
options("repos" = c(CRAN="https://mirrors.ustc.edu.cn/CRAN/"))#此为中科大cran镜像，清华bioconductor镜像为#options(BioC_mirror="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/bioconductor")
注意，此方法只能使用一个镜像（cran或bioconductor），不要选错！
2.包属于github包--手动下载
github包在国内一般无法直接下载，需要参考教程，下载zip或者其他途径下载（可bing，已经有完整教程）
3.老是报各种打不开url的神奇错误--别犹豫了，手动装包！
不要想着有warning或者error就一定要把它修好，装包这事儿，有时候报错怎么样都修不好。手动安装在这种情况下最节省时间。
bioconductor--手动装包
在bioconductor官网（Bioconductor - Home）搜索包名--下载zip文件
记住下载地址，在rstuodio打开packages界面，点击install，按照下载地址找到zip就好。
在下载包时间过长时也可以考虑直接手动装包，手动装包速度比等等等快10000%
4.连手动装包都还是可劲儿报错/报错空间不足
例子：安装reactome.db包（使用bioconductor:install和手动都报如下错误）
Error in download.file(url, destfile, method, mode = "wb", ...) :
download from 'https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/bioconductor/packages/3.16/data/annotation/src/contrib/reactome.db_1.82.0.tar.gz' failed
Warning in download.packages(pkgs, destdir = tmpd, available = available, :
下载程序包‘reactome.db’时出了问题
Installation paths not writeable, unable to update packages
path: C:/Program Files/R/R-4.2.1/library”
这是由于包的下载路径在C盘导致的。推荐在开始就把R包安装路径设置到别的盘；如果想更改，在目标盘下载一个同版本的R，使用lib.path()找到R包安装路径，把路径下所有包迁移过去（复制或剪切），再使用lib.path("内写新的安装路径")改变R包下载的默认位置即可。
