人类历史上面临过许多次爆发式、传染性、毒性强的疾病，也一直不断地与各类病毒性流感、肠胃型、肺炎性流感作斗争，现代科学医疗水平的进步，大大改善了人类的健康水平，也大幅度提升了人均寿命。那么我们的一些耳熟能详的药物到底是怎样治疗我们的呢？
比如说，在受到细菌感染时，一般采用抗生素治疗。我们所说的青霉素、红霉素等等都是这类药物，它们是微生物产生的次级代谢产物或人工合成的类似物。主要用于治疗各种细菌感染或致病微生物感染类疾病，一般情况下对其宿主不会产生严重的副作用。
抗生素在较低浓度下，就能选择性地对特定细菌的生长、繁殖产生抑制作用。通过抑制细菌的细胞壁的形成、打开细菌细胞膜通道、抑制细菌的DNA复制与转录、抑制细菌的蛋白质的合成等方式，杀死细菌。目前，人类主要面临的问题是，抗生素的滥用情况，人体内存在大量正常有益的菌群，如果用抗生素治疗无菌性炎症，这些药物进入人体内后将会压抑和杀灭人体内有益的菌群，引起菌群失调，同时造成有害细菌对抗生素产生抗药性，形成超级细菌，对人体健康反倒是有害的。
还有一种预防机制，那就是疫苗。疫苗是将病原微生物(如细菌、立克次氏体、病毒等)及其代谢产物，经过人工减毒、灭活或利用基因工程等方法制成的用于预防传染病的自动免疫制剂。
一种主要的疫苗治疗机制就是，通过将分离出来的病毒灭活，再注射到人体，人体的免疫机制能够在确保不被感染的情况下，自我保护，发生局部或短期免疫反应，产生抗体等免疫产物，之后，即使再次接触这类病毒，身体的免疫反应会根据记忆快速杀死病毒。疫苗的主要治疗应用在预防，不能在患病后对症治疗。
事实上，在被病毒感染之后，病毒在身体的潜伏期，在这期间注射疫苗也是有用的。比如狂犬病毒，我们都知道这种病毒如果爆发尚不能治疗，致死率百分之百。但是在被狗咬伤后，如果被病毒感染，会存在较长时间的潜伏期，只要在潜伏期内注射疫苗，提前产生抗体就能有效治疗这种疾病，越早注射效果越好。但是如果没有注射疫苗，身体自身免疫所产生的抗体不能及时杀死迅速复制的狂犬病毒，造成死亡。
在面对病毒性感染疾病时，往往由于病毒自身的基因复制特性，易于产生变异和进化，导致难以研发特效药。所以目前人类治疗病毒的手段，有服用阻断性药物抑制病毒的复制、注射激素和免疫增强剂以增强免疫能力、通过消炎治疗过度免疫的身体损伤等。
在面对流感的时候，辅助一定的治疗手段，人体的免疫能力往往能打败病毒，但是仍有重症造成器官损伤甚至死亡的风险。如果从病毒的角度出发，传染性强、毒性小，能够更多地传播和大范围的复制，才是更利己的进化方向。比如，美国每年至少千万人感染，其中平均约3万人死于流感，这也许比埃博拉病毒可怕得多。
