JCR以其大量的期刊统计数据及计算的影响因子等指数，而成为一种期刊评价工具。图书馆可根据JCR提供的数据制定期刊引进政策；论文作者可根据期刊的影响因子排名决定投稿方向。
一般来说学术期刊被引用得越多，影响因子通常越高，也就是说杂志被关注的越多impact factor 就越高，医学类好多杂志如《新英格兰杂志》、《柳叶刀》等因为看的人比较多，影响因子有些是很高的，尤其是综述类杂志。 但是，问题也不是绝对的。不能单单凭影响因子（IF）的高低来判断期刊的权威性，如美国科学院院报（PNAS）虽然每年的IF在10.0 左右，但是大家都知道其在学术界的影响力和权威性与<Nature>、<Science>等IF在30.0左右的杂志几乎旗鼓相当。 而且几乎每个学术领域都有自己的顶尖杂志，如糖尿病学、肝脏学等，暂且不管其影响因子大小，公认的权威杂志就是含金量最高的。 而古生物学、系统分类学等领域的很多杂志也有SCI收录的，由于专业性太强，很少有人看懂，也基本没什么应用价值，IF就很低。但是在其自己的领域，也有可能是最权威的。
美国《科学引文索引》（Science Citation Index, 简称SCI）于1957年由美国科学信息研究所在美国费城创办。40多年来，SCI（或称ISI）数据库不断发展，已经成为当代世界最为重要的大型数据库，被列在国际六大著名检索系统之首。它已成为国际上最具权威性的、用于基础研究和应用基础研究成果的重要评价体系。 科学引文索引（Science Citation Index, 缩写：SCI）是由美国科学情报研究所(Institute for Scientific Information,简称ISI)于1960年编辑出版的一部期刊文献检索工具，其出版形式包括印刷版期刊和光盘版及联机数据库。 影响因子（Impact factor，缩写IF）是美国科学情报研究所（ISI）的期刊引证报告(JCR）中的一项数据。指的是某一期刊的文章在特定年份或时期被引用的频率，是衡量学术期刊影响力的一个重要指标。由美国科学情报研究所创始人尤金·加菲得（Eugene Garfield）在1960年代创立，其后为文献计量学的发展带来了一系列重大革新。自1975年以来，每年定期发布于“期刊印证报告”（JCR）。 影响因子（Impact Factor,IF)： 即某期刊前两年发（S, T）表的论文在统计当年（U）的被引用总次数 X（前两年总被引次数）除以该期刊在前两年（S, T）内发表的论文总数 Y（前两年总发文量）。这是一个国际上通行的期刊评价指标。公式为： IFU =（X(S,T) / Y(S,T)）。 例如，某期刊2005年影响因子的计算；本刊2004年的文章在2005年的被引次数： 48 ；本刊2004年的发文量： 187；本刊2003年的文章在2005年的被引次数： 128 ；本刊2003年的发文量： 154；本刊2003-2004的文章在2005年的被引次数总计： 176 =（48+128）；本刊2003-2004年的发文量总计： 341 =（187+154）；本刊2005年的影响因子为0.5161 = （176÷341）
