今日任务:R语言基础
1 R语言基础环境配置
无需云服务器,直接在windows操作系统进行
注意避免中文安装路径,否则无法识别
(已提前安装成功)
Rstudio
调节镜像源 Rstudio内可直接调节默认设置
安装R packages
install packages("xlsx")
普通包的安装
安装生物数据分析包
安装BioManager
if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
install.packages("BiocManager")
BiocManager::install(version = "3.12")
调用BioManager,安装Bioconductor仓库特定包
BiocManager::install(c("GenomicFeatures", "AnnotationDbi"))
2 R语言实战
1. R project项目建立,便于工作管理
2.基本命令
setwd() /getwd()
设置/获取当前工作目录
dir()
显示文件列表
x<-a
赋值
rm(a)
清除变量
rm(list=ls())
清除global environment中所有变量
history()
列出历史记录
ctrl+L 一键清屏(Console)
3.绘图
plot(rnorm(50))
绘出以0为平均值,1为标准差的符合正态分布随机数50个
默认rnorm(n, mean = 0, sd = 1)
boxplot(iris$Sepal.Length~iris$Species,col =c("lightblue", "lightyellow", "lightpink"))
利用R中自带数据集iris中的Sepal.Length列和Species列作图,Length为y轴,Species为x轴,用色为蓝、黄、粉