常见错误:
说找不到Barcode文件,但明明存在Barcode:
Error in Read10X() : Barcode file missing
那很有可能是因为三个10X数据的命名出了问题,一定要命名成
"barcodes.tsv"
"genes.tsv"
"matrix.mtx"
【补充:cellranger的V2版本得到的结果分别是:
barcodes.tsv、
genes.tsv、
matrix.mtx;
V3版本得到的结果分别是:
matrix.mtx.gz、
features.tsv.gz、barcodes.tsv.gz】
说找不到基因文件,那么就要看看测序数据是不是解压后的
Error in Read10X() : Gene name or features file missing