近来对生信分析着迷,使用学习GEO,TCGA数据,可作为小白,在Baidu,Google等各大网站搜索,不得其法。值得慢慢尝试,终于摸索出一条道来!当然下载TCGA有很多种方法,比较全的是通过官网下载!
GDC工具下载:https://gdc.cancer.gov/access-data/gdc-data-transfer-tool
按照需要下载如Mac OSX,Windows,Ubuntu,下载
然后在NIH:NATIONAL CANCER INSTITUTE GDC Data Portal官网:https://portal.gdc.cancer.gov/,选择Repository
然后将下载好的软件gdc-client和manifest以及metadata放在同一个文件夹内,然后在文件间空白处shift+鼠标右键,运行powershell,输入代码 .\gdc-client download -m gdc_manifest_20200106_001339.txt,记得不要忘记加.txt。然后坐等下载完成!