单细胞空间多组学分析中的外显子分析部分

作者，Evil Genius

之前分享了很多关于多组学的内容了，其中涉及到外显子的部分分析呢，我基本都一笔带过了，很多高分文章都运用到了外显子突变类的信息分析，以下为文章示例

示例一

示例二


示例三，文章：A cellular and spatial atlas of TP53-associated tissue remodeling in lung adenocarcinoma
示例4、A spatial cell atlas of neuroblastoma reveals developmental, epigenetic and spatial axis of tumor heterogeneity
示例5


示例6

其中外显子SNV的分析，主要还是集中在基因组层面，我也写过了很多文章

外显子数据分析汇报汇总
外显子拷贝数分析之cnvkit
外显子数据分析之基因融合factora
肿瘤特检关于cancer hotspot的简单记录
单细胞空间突变信息分析导论
肿瘤突变负荷（TMB）及计算方法
肿瘤突变位点临床解读数据库：CIVIC、JAX CKB、My Cancer Genome

以及分享了各种数据库，我们要不要来一遍外显子的分析课程？

课表已备好

第一节：外显子分析基础知识与框架
第二节：fastq数据处理到call SNV + 基础认知
第三节（可能需要拆分成2节课）：各大数据库如何注释突变信息（clinvar、cosmic、gnomad、HGMD、hotspot 、oncoKB、md_aderson、civic 、candl、my cancer genome、PMKB、intervar、fathmm 数据库的认知与运用）
第四节：TMB + MSI + Fusion + CNV
第五节：获取生信文件如何进行用药解读
第六节：HRD + MRD

大约6~7节课吧，当然了，掏钱总是痛苦的，我也一样，暂定1500吧，想报名的可以留言，当然了，人少我们就不上了，正好休息休息。

生活很好，有你更好

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