模型不如意十之八九,可拿出手无二三

今天又来开放性讨论啦。
最近做了一个TCGA的数据分析,走到最后多因素cox模型构建这一步了,选择了三个基因,对数据集划分了高低风险,C-index值和timeROC计算的AUC值都还看得过去,but,就训练集的高低风险KM-plot出现了如此哭笑不得的交叉?(连测试机都没交叉,怎么训练集还叉上了)

疾病是乳腺癌,横坐标是月

我发朋友圈问研究肿瘤的医学生们,模型成这种情况,是否可以使用?没想到这个问题很多人感触颇深,戳中了痛点:怎么看自己的模型,都是歪瓜裂枣,要么C-index值不够美丽,要么AUC值凄凄惨惨,要么就不稳定,训练集壮得像头牛,跑到测试集立刻痛哭流涕。

还有人晒出了寄几的同款图


以及已发表文章里那蜿蜒曲折的交叉???


看来我提的还是一个比较痛点的问题吧,在朋友圈和几个群里发出去,有幸收到了三五十条回复,我把讨论结果跟大家分享一下,总共有以下几个观点:

  1. 可以使用,因为p值小于0.05,并且趋势是对的。
  2. 不能使用km plot,因为出现了交叉,不适合使用km plot。
  3. 交叉点在100个月以后,所以可以只讨论5年内或者8年内的,不考虑生存时间超长的那些病人(建模时去掉他们)。
  4. 可以分段讨论,说明一下为什么出现了交叉,我看到比较有说服力的理由是,可能因为过了100个月后,样本的数量太少,导致比例变化大,不具有代表性了。

还想问一下,这一张,一小点的交叉,是否可能会被卡呢,要如何解释一下才好?

疾病是乳腺癌,横坐标是月

我来发个投票和讨论,欢迎并感谢大家发表自己的见解~

©著作权归作者所有,转载或内容合作请联系作者
  • 序言:七十年代末,一起剥皮案震惊了整个滨河市,随后出现的几起案子,更是在滨河造成了极大的恐慌,老刑警刘岩,带你破解...
    沈念sama阅读 215,923评论 6 498
  • 序言:滨河连续发生了三起死亡事件,死亡现场离奇诡异,居然都是意外死亡,警方通过查阅死者的电脑和手机,发现死者居然都...
    沈念sama阅读 92,154评论 3 392
  • 文/潘晓璐 我一进店门,熙熙楼的掌柜王于贵愁眉苦脸地迎上来,“玉大人,你说我怎么就摊上这事。” “怎么了?”我有些...
    开封第一讲书人阅读 161,775评论 0 351
  • 文/不坏的土叔 我叫张陵,是天一观的道长。 经常有香客问我,道长,这世上最难降的妖魔是什么? 我笑而不...
    开封第一讲书人阅读 57,960评论 1 290
  • 正文 为了忘掉前任,我火速办了婚礼,结果婚礼上,老公的妹妹穿的比我还像新娘。我一直安慰自己,他们只是感情好,可当我...
    茶点故事阅读 66,976评论 6 388
  • 文/花漫 我一把揭开白布。 她就那样静静地躺着,像睡着了一般。 火红的嫁衣衬着肌肤如雪。 梳的纹丝不乱的头发上,一...
    开封第一讲书人阅读 50,972评论 1 295
  • 那天,我揣着相机与录音,去河边找鬼。 笑死,一个胖子当着我的面吹牛,可吹牛的内容都是我干的。 我是一名探鬼主播,决...
    沈念sama阅读 39,893评论 3 416
  • 文/苍兰香墨 我猛地睁开眼,长吁一口气:“原来是场噩梦啊……” “哼!你这毒妇竟也来了?” 一声冷哼从身侧响起,我...
    开封第一讲书人阅读 38,709评论 0 271
  • 序言:老挝万荣一对情侣失踪,失踪者是张志新(化名)和其女友刘颖,没想到半个月后,有当地人在树林里发现了一具尸体,经...
    沈念sama阅读 45,159评论 1 308
  • 正文 独居荒郊野岭守林人离奇死亡,尸身上长有42处带血的脓包…… 初始之章·张勋 以下内容为张勋视角 年9月15日...
    茶点故事阅读 37,400评论 2 331
  • 正文 我和宋清朗相恋三年,在试婚纱的时候发现自己被绿了。 大学时的朋友给我发了我未婚夫和他白月光在一起吃饭的照片。...
    茶点故事阅读 39,552评论 1 346
  • 序言:一个原本活蹦乱跳的男人离奇死亡,死状恐怖,灵堂内的尸体忽然破棺而出,到底是诈尸还是另有隐情,我是刑警宁泽,带...
    沈念sama阅读 35,265评论 5 341
  • 正文 年R本政府宣布,位于F岛的核电站,受9级特大地震影响,放射性物质发生泄漏。R本人自食恶果不足惜,却给世界环境...
    茶点故事阅读 40,876评论 3 325
  • 文/蒙蒙 一、第九天 我趴在偏房一处隐蔽的房顶上张望。 院中可真热闹,春花似锦、人声如沸。这庄子的主人今日做“春日...
    开封第一讲书人阅读 31,528评论 0 21
  • 文/苍兰香墨 我抬头看了看天上的太阳。三九已至,却和暖如春,着一层夹袄步出监牢的瞬间,已是汗流浃背。 一阵脚步声响...
    开封第一讲书人阅读 32,701评论 1 268
  • 我被黑心中介骗来泰国打工, 没想到刚下飞机就差点儿被人妖公主榨干…… 1. 我叫王不留,地道东北人。 一个月前我还...
    沈念sama阅读 47,552评论 2 368
  • 正文 我出身青楼,却偏偏与公主长得像,于是被迫代替她去往敌国和亲。 传闻我的和亲对象是个残疾皇子,可洞房花烛夜当晚...
    茶点故事阅读 44,451评论 2 352