转录组数据上传至SRA(二)

根据网上所说步骤,进展到最后一步file时,不会上传,其他教程里也没有详细描写,折腾了两天,还花了钱请教别人。

因此这里主要写如何通过ftp、aspera上传至NCBI。

(一)ftp上传

1.先下载filezilla.

2. 输入主机、用户名、密码(NCBI提供的三个)。

此时总是出现响应550 permission denied,错误。不用管它,直接输入NCBI给的目录

点开自己的本地站点目录

3.右键文件上传,传完关闭filezilla即可。

(二)aspera命令行上传

1. 下载aspera connect软件安装

2.开始菜单搜索cmd,打开

3. 打开显示C:\Windows\system32,光标一直在后面,重启下一行还是。

所以之后加一个 cd D:/,切换到存储aspera的那个盘(此处要搜索aspera安装在哪里,找到bin文件夹)

cd命令用于切换目录,切换到子文件夹目录,直接接子文件夹目录名

4. 用cd命令切换到aspera connect\bin

5. 完成后输入NCBI让输入的命令行,

ascp -i <path/to/key_file> -QT -l100m -k1 -d <path/to/folder/containing files>subasp@upload.ncbi.nlm.nih.gov:uploads/xxxx

中间不用另起一行,直接接着文件夹名后输入

l100m中的l是小写的L(这个尝试了好久)

输入完成后回车,文件即自动上传。

©著作权归作者所有,转载或内容合作请联系作者
平台声明:文章内容(如有图片或视频亦包括在内)由作者上传并发布,文章内容仅代表作者本人观点,简书系信息发布平台,仅提供信息存储服务。