Aberrant enhancer hypomethylation contributes to hepatic carcinogenesis through global transcriptional reprogramming
Methyl-binding DNA capture sequencing (MBDCap-seq)
33 pairs of HCC tumors and matched non-tumor tissues
区域内DNA甲基化程度
区域富集功能 WebTools开发
5' 3' enhancer SE Atac ...
Encode 基因组15种区域分类
隐马模型 segment
全基因组甲基化测序(BS-seq)WGBS
单碱基CPG位点甲基化测序
FANTOM5 存储了enhancer和靶基因
找到enhancer区域里面的差异甲基化位点并且个数>10个定义为差异enhancer区域，把所有甲基化探针和靶基因做相关
CAGE是短序列标签
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Enhancer 定义条件
H3K4me1/H3K4me3 越高证明存在enhancer
H3K27ac信号存在 说明enhancer有活性
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形成loop图片.png
好看的图
diffTools
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