一. 向量
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向量，元素，标量区别
图引自生信星球
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赋值
给变量定义就是赋值, 注意以最后一次为准！注意以下常用表达
x<-c(1,2,3)#常用的向量定义写法，意为将x定义为由元素1，2，3组成的向量。
x<-(1:10)#从1-10之间所有的整数
x<-seq(1,10,by = 0.5)#1-10之间每隔0.5取一个数（注意这里是逗号不是分号）
x<-rep(1:3,times=2)#1-3 重复2次 -
从向量中提取元素
1.根据元素位置
这里的x是你刚才赋值的变量名，根据自己的情况来修改
x[4]#x第4个元素
x[-4]#排除法，除了第4个元素之外剩余的元素
x[2:4]#第2到4个元素
x[-(2:4)]#除了……
x[c(1,5)]#第1个和第5个元素
2.根据值的大小
x[x==10]#等于10的元素
x[x<0]
x[x %in% c(1,2,5)]#存在于向量c（1，2，5）中的元素
二. 数据框
- 练习时先将doudou.txt和huahua.txt数据放在RData文件夹下
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读取本地数据
read.table(file = "huahua.txt",sep = "\t",header =T)#读取文件，分隔符为Tab(点tab键可以出来seq)，有表头
a<-read.table(file = "huahua.txt",sep = "\t",header =T)#把这个数据框赋给一个变量a -
设置行名和列名
X<-read.csv('doudou.txt')#在示例数据里有doudou.txt 注意这里的变量X是一个数据框
colnames(X)#查看列名
rownames(X)#查看行名,默认值的行名就是行号，1.2.3.4...
colnames(X)[1]<-"bioplanet"#有的公司返回数据，左上角第一格为空，R会自动补为x,用这个命令来修改
X<-read.csv(file = "huahua.txt",sep = "\t",header =T,row.names=1)#最后row.names的意思是修改第一列为行名
撤销吗: 用刚才的read.table命令重新赋值一遍就可以覆盖了."变"量看最后一次！） -
数据框的导出
write.table(X,file = "yu.txt",sep = ",",quote=F)#其中sep = ","是分隔符改为逗号，quote=F表示字符串不加双引号（默认格式带有双引号） ，而quote函数如果为TRUE的话则表示要带双引号，如果是FALSE，就像这里的quote=F表示不加双引 -
变量的保存与重新加载
保存的格式是RData。
save.image(file="bioinfoplanet.RData")#保存当前所有变量
save(frame1,file="frame1.RData")#保存其中一个变量
load("frame1.RData")#再次使用RData时的加载命令 -
提取元素
这里的X是指的我用过的一个变量名，实际应用要懂得替换。刚才让师姐测试我教程的时候很担忧你们粗暴地复制我的代码，最后啥也没看懂。
X[x,y]#第x行第y列
X[x,]#第x行
X[,y]#第y列（横着写）
X[y]#第y列（竖着写）
image.png
X[a:b]#第a列到第b列
X[c(a,b)]#第a列和第b列
X$列名#也可以提取列（并且支持Tab自动补全，不过只能提取一列，优秀写法） -
直接使用数据框中的变量
比如要取提取列名case和values的为某两列作散点图：
1. 方法1
c <-data.frame(case=paste("S",c(1:50)),values=runif(50))这里的paste是拼接字符串的函数
plot(c$case,c$values)
但这里说这里这种方法有个缺点：数据框名a在代码中重复出现（此处试验了下没有）
2. 方法2（这种方法数据框名a在代码中就不重复出现了）
with(c,{
+ plot(case,values)
x<<-summary(values)#求和并赋值给x,<<的意思是作为全局变量，也就是出了with循环仍有效。
})
什么是with循环? 如下百度感觉很形象
image.png
全局变量含义？
函数内部的变量通常为局部变量，可以通过 <<- 赋值，成为全局变量，这样就可以在其他函数中被调用。
三.其他注意TIP
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脚本窗口使用
新建脚本，并在里面打代码/粘贴大神代码。然后保存到RDATA工作目录下，打开,注意脚本文件的后缀就是R
image.png -
在哪看变量
引自生信星球
image.png 其他潜意识小tip
来自生信星球的大神总结
（1）R的赋值符号不是等号，而是<-
（2）在Console 控制台输入命令，相当于Linux的命令行
（3）R的代码都是带括号的，括号必须是英文的。
（4）显示工作路径getwd()
设置工作路径setwd("C:/Users/kingjie/Desktop/Rdata")
（5）向量是由元素组成的，元素可以是数字或者字符串。
（6）表格在R语言中改名叫数据框_
（7）别只复制代码，要理解其中的命令、函数的意思。函数或者命令不会用时，除了百度/谷歌搜索以外，用这个命令查看帮助：?read.table，调出对应的帮助文档，翻到example部分研究一下。
（8）数据类型(两重点)
向量（vector）,矩阵（Matrix）,数组（Array）,数据框（Data frame）,List
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