使用 http://www.cbioportal.org/index.do
背景
1.cBioPortal提供大规模癌症基因组学数据集的可视化，分析和下载。
2.TP53是肝癌最常见的基因突变之一，与不良预后密切相关。
1.打开http://www.cbioportal.org/index.do
2.选择liver cancer，输入TP53 gene
image.png
3.submit一下，我们要可视化，所以plot
image.png
左栏可以选择数据类型以及分类
4.我们看一下性别差异吧
image.png
当然 我们可以自己画
1.从cbioportal网站下载表达数据
image.png
image.png
2.打开R，input数据，代码如下
plot_liver_cancer <- read.table("plot_liver_cancer.txt",sep = "\t",fill = T,header = T)
colnames(plot_liver_cancer)=c('id','subtype','expression','mut')
dat=plot_liver_cancer
library(ggstatsplot)
ggbetweenstats(data =dat, x = subtype, y = expression)
上图
image.png
参考来源：生信技能树
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