一、Anaconda安装
MultiQC的安装需要conda环境,因此先配置conda
1 wget http://repo.anaconda.com/archive/Anaconda3-5.2.0-Linux-x86_64.sh
2 sh ~/Anaconda3-5.2.0-Linux-x86_64.sh
3 nano ~/.bashrc
4 source ~/.bashrc
5 conda --version
二、MultiQC的安装
conda install -c bioconda multiqc
安装成功:
三、MultiQC运行
将test_7942raw_1.fq、test_7942raw_2.fq上传到Seqs目录下,在Seqs目录下直接输入以下命令,以对当前目录下的数据分析。
multiqc .
或multiqc 【要分析的文件路径】
multiqc test_7942raw_1.fq
截屏如下: