学习 | BLUP与全基因组选择

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PPT 链接:http://nitro.biosci.arizona.edu/workshops/Synbreed2013/Lectures/Lecture28.pdf

1. 作者及题目

2. BLUP是怎么起作用的?

很简单,通过构建混合线性模型,估计个体的育种值(BLUP),然后可以推断出子代的育种值应该是亲本的平均值。选择BLUP大的个体就行了。

3. 混合线性模型经典公式

简写矩阵形式:

MME形式:

4. BLUP值标准误的计算方法

5. 动物模型各元素的关系

R,G以及A,加性方差组分,残差方差组分的关系。

6. BLUP的准确性和可靠性

7. BLUP选择的优势

  • 可以容易的考虑固定因子
  • 构建A矩阵,考虑亲缘关系
  • 对不平衡性试验支持
  • 可以估计后代的值(根据亲本)

8. BLUP的缺点

  • 方差组分不是已知的,有误差
  • 相对于大规模选择(mass selection),BLUP的方法容易增加近交系数

9. BLUP的扩展

比如重复测量,母体效应,多性状模型等等

10. BLUP到GBLUP的过渡

11. 指数选择

12. GBLUP介绍

13. 基因组选择

14. 基因组选择的优势

15. 基因组选择适合的性状

16. 基因组选择与近交系数

  • 模拟数据显示,GS相对于传统BLUP,能够降低近交系数。因为孟德尔抽样误差可以被估计,这样相似度高的全同胞不会进行组配。
  • 但是,因为GS降低了世代间隔,每年的近交增量可能会比传统方法更大。

17. 原文更精彩

原文更精彩,我就不截图了。文献虽然很老,但是道理说得很透。


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动物育种数据分析的效益和挑战


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