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只有对自己有帮助的,才是对别人有帮助的。-------这是哪个人说的来着???
PPT 链接:http://nitro.biosci.arizona.edu/workshops/Synbreed2013/Lectures/Lecture28.pdf
1. 作者及题目
2. BLUP是怎么起作用的?
很简单,通过构建混合线性模型,估计个体的育种值(BLUP),然后可以推断出子代的育种值应该是亲本的平均值。选择BLUP大的个体就行了。
3. 混合线性模型经典公式
简写矩阵形式:
MME形式:
4. BLUP值标准误的计算方法
5. 动物模型各元素的关系
R,G以及A,加性方差组分,残差方差组分的关系。
6. BLUP的准确性和可靠性
7. BLUP选择的优势
- 可以容易的考虑固定因子
- 构建A矩阵,考虑亲缘关系
- 对不平衡性试验支持
- 可以估计后代的值(根据亲本)
8. BLUP的缺点
- 方差组分不是已知的,有误差
- 相对于大规模选择(mass selection),BLUP的方法容易增加近交系数
9. BLUP的扩展
比如重复测量,母体效应,多性状模型等等
10. BLUP到GBLUP的过渡
11. 指数选择
12. GBLUP介绍
13. 基因组选择
14. 基因组选择的优势
15. 基因组选择适合的性状
16. 基因组选择与近交系数
- 模拟数据显示,GS相对于传统BLUP,能够降低近交系数。因为孟德尔抽样误差可以被估计,这样相似度高的全同胞不会进行组配。
- 但是,因为GS降低了世代间隔,每年的近交增量可能会比传统方法更大。
17. 原文更精彩
原文更精彩,我就不截图了。文献虽然很老,但是道理说得很透。
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学习 | 遗传力与田间试验设计
学习一个PPT:育种中混线性模型的应用
动物育种数据分析的效益和挑战