写在前面
年前,推了两个插件,主要针对基因克隆实验中常见需求,即引物设计以及Sanger测序结果解读....(主要还是为了情怀,都是我接触生信之前一直想要的功能...),对应了三个推文:
- 《实用 | PCR 引物特异性?用Primer Check检测一下》
- 《眼见为实!Sanger测序峰图比对到参考序列 - 直观!》
- 《有点意思!Sanger 测序峰值图自动解析单倍型》
其中最后一个推文事实上,是在「TBtools」老铁使用过之后做了增强。转眼两周过去了。万万没想到,不少湿实验的朋友过年期间一直在加班干实验。今天下午,收到南农和老师的反馈信息,主要建议增加一个批量模式,主要原因是,往往基因编辑的结果材料有几十上百株系,而不仅仅是三五个...原本相关工作需要数天,有了插件可能还需要三四天,但如果支持批量模式,那么....
完全在理。收到这个反馈信息的时候,我突然觉得「TBtools」工作确实没做到位。开发「TBtools」的出发点在于减少湿实验科研人员在数据分析上的时间投入,让大伙更多陪伴家人。
稍微迟疑了一会,采纳了和老师的建议,并做了简单调整,于是得到新版插件,暂时略去交互分析,重在批量处理。
Batch Sanger Sequencing Result Check
新插件的界面如下:
相关使用简单,直接给个示例
运行结束后,可以在设置的输出目录中看到输出文件,大体如下
感觉不错~
写在最后
Emmm.... 正如前述,
- 一个好用的工具,常常用户很多;
- 而用户很多的工具,常常才会是好用的工具。
PS: 「生信药丸」上不时会恰饭,后台留言有不少意见....大伙可以有意见,但饭就是要恰,没得商量。
差点忘了....