在对 vcf 文件压缩时,不可以用 gzip 来代替 bgzip;
压缩
bgzip -f view.vcf
解压缩
bgzip -d view.vcf.gz
或者
gunzip view.vcf.gz
建索引(tbi格式结尾的索引文件)
tabix -p vcf view.vcf.gz
##
获取位于11号染色体的SNP位点
tabix view.vcf.gz 11
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获取位于11号染色体上突变位置大于或者等于2343545的SNP位点
tabix view.vcf.gz 11:2343545
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获取位于11号染色体上突变位置介于2343540到2343596的SNP位点
tabix view.vcf.gz 11:2343540-2343596