root用户的命令行以#开头
目录 文件命名：
由字母，下划线，数字组成，不要以数字开头，不要使用特殊符号
下划线命名法：project_backup
峰驼法：projectBackup
3.数据下载
Aim：airway数据下载
由文献得到GEO accession：GSE52778
image.png
GEO数据库内搜索 得到
BioProject：PRJNA229998
SRA：SRP033351
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方法一：sra-tools工具：在SRA数据库使用SRA编号 得到AccList
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得到SRR编号，使用sra-tools工具包的prefetch命令下载数据
法1.用已下载好的数据
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法2..sra-tools工具包的prefetch命令（官方工具）
# 使用prefetch命令下载单个文件：如SRR1039510
prefetch SRR1039510
# 批量下载：建立循环，并查看
# =号两边没有空格
outputdir=/teach/project/Human-16-Asthma-Trans/data/rawdata/sra
cat sampleId.txt | while read id
do
echo "prefetch ${id} -O ${outputdir} "
done >download.sh
# 运行脚本，由于服务器资源有限，运行不报错就好了，ctrl+C强制退出
nohup sh download.sh >download.log &
# 验证数据的完整性
vdb-validate SRR1039510
方法二.使用aspera下载(推荐)
aspera下载：使用BioProject编号在ENA数 据库得到aspera下载链接
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tax id:物种编号缩写，人是9606
scientific_name：Homo sapiens 人的物种的拉丁文
library layout:paired双端测序
安装aspera软件
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