报告基因: 萤火虫荧光素酶
内参基因:海参荧光素酶
应用,我需要用到的两个方面:
1.验证miRNA和mRNA靶向互作,将待测基因的3'UTR序列插入报告基因载体,再共转入该miRNA,检测荧光素酶活性下降,则提示为其靶基因。
2.验证miRNA同lncRNA靶向互作。将待测lncRNA序列插入报告基因载体的3'UTR区域,检测荧光素酶活性。
实验步骤:
1、报告基因质粒的构建。将目的片段插入到荧光素酶表达的报告基因载体上,如pGL3-basic。
2、转染细胞。将报告基因质粒和phRL-TK(内参)共转染细胞,根据需要对细胞进行处理。共转染时,由于内参具有很强的启动子,因此报告基因质粒:内参转染量一般为10:1~50:1。
Luciferase活性测定:
⑴ 初次使用时,配制LAR II,即Firefly luciferase的底物。将LAR II溶解在LAR II buffer中,并分装-80℃避光保存。
⑵ 加入1X PLB,室温裂解细胞15 min。
⑶配制Stop&Glo,即Renilla luciferase的底物,能够终止LAR II的反应。
⑷ 测定荧光值。向40 ul的LAR II中加入10 ul细胞裂解液,吹打混匀后,检测读数,即为Firefly luciferase的值。加入40 ul Stop&Glo,再次读数,即为Renilla luciferase的值。
⑸ 数据处理。首先计算出每管的Firefly luciferase/Renillaluciferase的比值,再以control组的比值为单位1,即可得到不同处理组的相对luciferase活性,也就是该处理组基因转录的调控活性。
作者:生物女学霸
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来源:简书
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lincRNA与miRNA的靶向互作实例。
需要的质粒:
1.firefly
a.原始质粒
b.插入目的序列质粒
c.插入突变/缺失序列的质粒
2.Renilla
d.renilla 原始质粒
实验注意事项:
主要流程:
1.报告基因质粒构建
2.细胞转染,细胞处理
3.报告基因检测
4.结果计算
基因质粒构建中,分情况而言,启动子研究中构建到fluc上游,而我的lnc研究中是将lnc序列构建在3'UTR序列上。
细胞转染:
1.我这次选择的是瞬时转染,我不需要大批量的实验。
2.转染方法上一般有三种:
磷酸钙沉淀法、阳离子脂质体、阳离子聚合物。
转染效率影响因素:
试剂选择:
数据处理!重要!!
实验具体步骤:
1.铺板
PBS清洗293T细胞2~3次(10cm皿),加入胰酶1ml,37℃消化1min,加入含血清DMEM(百分之5血清)2ml终止消化,吹打下细胞。转移至15ml离心管中,1000RPM离心5min。
2.弃上清,2mlDMEM重悬细胞,铺板(每个样品设置3个复孔), 培养箱中培养, 待细胞密度70-80%可以转染。
分组设计:
空白组(转染试剂+细胞)
质粒组
质粒+miRNA nc组
质粒+miRNA mimics组
其他准备:(转染试剂的配置)
3.转染(其中要根据转染试剂说明书具体调整,每种品牌的转染试剂要求不一样的)
a 取质粒(两种荧光素酶质粒加上miRNA的模拟物等)和转染试剂分别加入含50ul无血清!!DMEM的EP管中 。 混匀,常温孵育5min。
b 将上诉两种混匀,室温孵育15min。
c 去除孔板中的培养基,加入无血清DMEM吼,加入上一步制备的转染复合物,混匀(根据说明书调整液体), 37℃培养4-6小时,去除培养基,加入含血清培养基, 37℃培养48h。
双荧光素酶检测
1.裂解细胞(需要购买裂解液PLB,使用前放至常温)
24孔板中每孔加入细胞裂解液体200ul。 冰上裂解10min(注意无酶操作)。
- 收集裂解液,离心,取上清,加入96孔板,每孔25ul/10ul。(每组重复5次,我看视频是这样子的)
3.配置海参荧光素酶工作液体
4.萤火虫荧光素酶检测
开启化学发光仪,在96孔板中每孔加入100ul萤火虫素酶检测工作液混匀,上机测发光值(测量时间0.1s)。(此步需要闭光)
检测后
5.海肾荧光检测
每孔加入海参荧光工作液100ul ,混匀,(设置发光波长后,测量时间0.1s)。
后续就是实验分析。
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