原作者：六六_ryx
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本文根据作者原文去除了肿瘤学方面的数据库，并根据个人体会做了修改，方便非肿瘤专业者阅读。
1. DrugBank:
DrugBank（version 5.1.4, released 2019-07-02）介绍了13,341 多个药物的名称、研究历史、化学结构、处方剂量、理化性质、适应症分类、药理学研究、药物相互作用、临床试验、相关制药公司、价格、专利号、基因或蛋白质靶标、该药物的转运蛋白等，相关的参考文献也都详细地列在旁边。
可以对药物本身的性质进行查询，也可以对药物与组学相关信息进行查询。
收集了史上最完整的与药物基因组相关的基因型和表型信息，并将这些信息系统地归类。截至2016年7月，该数据库收录了与3579 种药物和3410种疾病相关27007个基因的资料。同时包含临床指南等信息。
3. 精准医学知识库iCMDB
https://origogenome.cn/web/login.html
iCMDB。它结合多方数据构建药物基因组学模块，用以阐明遗传变异、药物与疾病的关联关系。对肿瘤、心脑血管疾病、血液疾病、神经系统疾病、内分泌疾病、风湿免疫等疾病在用药过程中的个体差异及移植过程中的排异反应进行全面评估
4.药物干扰转录组数据库
Connectivity Map (CMap:https://portals.broadinstitute.org/cmap/) 包含了大约1300多个现存药物或尚在实验室研究的小分子处理细胞后的microarray基因表达数据。该数据库于2006被公开发表于Science和Nature从而面向大众使用，是迄今为止最全面的关于药物干扰处理的开放的转录组数据库，隶属于美国麻省理工学院、哈佛大学共同创办的Broad Institute。利用该数据库，我们可以找到一个药物处理后的差异表达基因，即在转录组层面造成的影响，可以和疾病的转录组数据结合来看该药物处理后的基因表达情况是否与疾病病人样本相反，从而找到潜在的治疗疾病的药物。
基于文献挖掘和整理的已知的药物-基因相互作用
药物数据库，支持疾病、药物、靶标分子搜索
6. http://bidd.nus.edu.sg/group/cjttd/
药物靶标数据库，提供了已知的和在探索中的蛋白质和核酸靶标，疾病、通路等信息
7. https://clinicaltrials.gov/
临床实验数据库
8. http://www.genome.jp/kegg/drug/
KEGG药物数据库，主要包含药物的化学结构、成分、相关的治疗靶标、代谢酶、分子作用网络等。
9. http://insilico.charite.de/supertarget/
药物靶标分子作用
10. http://sideeffects.embl.de/
药物副反应数据库
