本人因为m6A测序数据到手后需要用到m6A可视化的R包，因此在网上找到了一个新出的Funm6AViewer package包，然后捣鼓了好几天才成功安装上这个包，在这里记录一下，也为后面需要用到此包的同学提供一些经验。
先说一下我的安装环境：
操作系统:win10 LTSC
R：R-4.1.3
Rstudio：RStudio 2022.02.3 Build 492
Rtools：rtools40
首先按照指示：安装这些依赖包
结果没看清楚后面有个“version = "3.10"”，导致一直报错还找不到原因，后面将这句删除掉之后才开始安装。
安装完成之后，按照提示，输入：devtools::install_github("NWPU-903PR/Funm6AViewer")
开始安装之后，提示：没有这个DLL ‘Rcurl’：是不是没有为此架构安装？”
可恶，我明明之前安装了Rcurl的Windows binaries包啊，我在Rstudio里面输入library(Rcurl)也正常啊，没有报错。
难道是需要源码安装吗？
那就试试吧。
在R curl链接上下载Package source:RCurl_1.98-1.9.tar.gz源码包之后，在Rstudio里面安装install.packages("E:/RCurl_1.98-1.9.tar.gz", repos = NULL, type = "source")，结果又报错了！
fatal error: curl/curl.h: No such file or directory
好在在CSDN上面找到了解决办法：在Rstudio安装RCurl报错—fatal error: curl/curl.h: No such file or directory，评论区里面有位大佬说
那就试试吧。
找到C:\rtools40下面的mingw32.exe和mingw64.exe，双击打开之后
然后复制大佬的命令：pacman -Sy mingw-w64-{i686,x86_64}-curl
然后提示是否安装，果断选yes!
安装成功之后，打开mingw64.exe
输入上面同样的命令，然后果断输入yes。
安装成功之后，重新在Rstudio下输入install.packages("E:/RCurl_1.98-1.9.tar.gz", repos = NULL, type = "source")
很好，成功编译安装了。
library(Rcurl)也不报错。
然后继续devtools::install_github("NWPU-903PR/Funm6AViewer")
然鹅
又报错了！
这次提示我AnnotationDbi这个包有问题。
行吧，重新装一下，先remove.packages("AnnotationDbi")，然后BiocManager::install("AnnotationDbi")。
完成之后，library(AnnotationDbi)，没报错。
就在我以为能继续安装的时候，结果还是报错！
那就只好再试试源码安装AnnotationDbi包了。
去bioconductor下载源码包：Bioconductor - AnnotationDbi，拉到最下面，下载 Source Package AnnotationDbi_1.44.0.tar.gz
重新去Rstudio安装，结果又是报错！
“没有这个DLL ‘RSQLite’：是不是没有为此架构安装？”
我印象中是有这个包的啊
library(RSQLite)也是正常的啊
那就直接源码安装吧
CRAN - Package RSQLite (r-project.org)下载源码包，在Rstudio安装
嗯，这次没有报错，安装成功了。
那就继续安装AnnotationDbi源码包
成功安装了！
那就可以继续devtools::install_github("NWPU-903PR/Funm6AViewer")了。
结果还是报错！
这次是org.Hs.eg.db包报错
报错大概意思是：org.Hs.eg.db要求的AnnotationDbi版本试>=1.5.5，但是我在bioconductor里面找到的最新的AnnotationDbi包也才1.4.4啊！
那应该是我的org.Hs.eg.db包太新了。
于是我又去bioconductor下载了org.Hs.eg.db_3.5.0.tar.gz的源码。
在Rstudio里面重新安装了之后，继续devtools::install_github("NWPU-903PR/Funm6AViewer")
然而，又报错了！
这次是XML包报错了：“没有这个DLL ‘XML’：是不是没有为此架构安装？”
又是个需要源码安装的包！
去CRAN下载XML的源码文件之后，开始安装，结果又是报错。
“libxml/parser.h: No such file or directory”
百度发现，这个报错好像大部分发生在linux系统上，好不容易在GitHub上面找到类似的问题从源代码 Rtools40 进行 XML 安装 ·问题 #3 ·R-Windows/Rtools-installer ·GitHub
里面有提到 pacman -S mingw-w64-{i686,x86_64}-libxml2
那就再去C:\rtools40下面的mingw32.exe和mingw64.exe里面输入这段代码试试
在里面安装好libxml2包之后，再去Rstudio安装XML源码包，结果还是报错！
提问者有提到“XML包不会自动在libxml2上获取”，但是他评论后面贴出来的链接挂了，唉。
然后又看到有这篇文章libxml常见错误：fatal error: libxml/parser.h: No such file or directory解决方法 - 代码先锋网 (codeleading.com)，我猜想是不是libxml2包已经在rtools里面下载安装好了，但是还需要像这里面一样建立一个软连接？
于是，打开C:\rtools40下面的mingw32.exe，输入ln -s C:/rtools40/mingw32/include/libxml2/libxml C:/rtools40/mingw32/include/libxml，回车。
再打开mingw64.exe，输入ln -s C:/rtools40/mingw64/include/libxml2/libxml C:/rtools40/mingw64/include/libxml，回车。
再回到Rstudio，继续安装XML的源码包，成功了！
继续devtools::install_github("NWPU-903PR/Funm6AViewer")
成功了！
library(Funm6AViewer)也没有报错。
这次解决这些报错虽然过程比较坎坷，但还是收获颇丰啊！
