文章
“Estimation of genetic and crossbreeding parameters of fatty acid concentrations in milk fat predicted by mid-infrared spectroscopy in New Zealand dairy cattle”
https://doi.org/10.1017/S0022029914000272
“Genetic correlations of milk fatty acid contents predicted from milk mid-infrared spectra in New Zealand dairy cattle”
https://doi.org/10.3168/jds.2019-17971
分享这两篇文章的原因，是其（同一作者）比较全的展示了MIR在奶牛育种的应用过程。主要借鉴其研究的方法，非常经典。作者也持续做这样一个研究，也非常值的我们学习，研究一个问题，要持续更深入的研究，不能只是换个材料，重复同样的工作。
作者显示基于气相色谱检测牛奶中各脂肪酸（FFA，23种）的含量，作为参考值（848个奶样），同时检测牛奶的MIR。 对MIR进行一定预处理，使用PLS算法建立各FFA预测模型。使用建立的预测模型基于其他的牛奶MIR进行FFA预测，这样就得到更多的FFA表型值（34141）。同时MIR还预测的Fat percentage, protein percentage, lactose percentage. 使用单变量重复力模型对以上各性状分别进行遗传方差估计，计算各自的遗传力和重复力。 再使用双变量重复力模型对以上性状进行两两分析，得各性状之间的遗传方差，计算表型和遗传相关。这样就可以为实际育种时提供参考。
优化
进一步，个人认为应该可以再计算各FFA育种值，探究加入目前育种选择时，对其他性状的具体影响。同时也可以做GWAS分析，查看FFA具体被哪些基因影响，通过什么通路调节，探究一下遗传相关的遗传机理。
这是目前MIR参与奶牛育种的主要主要途径。MIR目前还对其他难测定的表型进行了预测，如甲烷排放，DMI. RFI等。这些都是类似的途径参与奶牛育种。
