前面小编给大家介绍过几个研究热点相关的基因集
☞ 铁死亡相关基因集
在上一期的内容里面,我们给大家简单的介绍了
大家应该对m5C甲基化的概念和这个科研方向有了一定的了解。
这些与科研热点相关的基因集合结合分析的基本套路都是先做差异表达分析,然后跟这些热点的基因集取个交集,绘制差异表达基因的heatmap,然后使用boxplot展示具体的基因的差异表达情况,然后再做后续分析。例如针对这些基因进行单因素,多因素cox回归,lasso回归,寻找显著跟生存相关的基因,然后构建风险评估模型。
今天小编就将m5c甲基化相关的基因分享给大家。从下面这篇文章中,我们就能从方法部分找到相关的基因的名字。
可以看到在方法部分,例举出了13个m5C甲基化相关的基因。
为了方便大家复制粘贴,我们将13个基因的名字整理如下。
NOP2
NSUN2
NSUN3
NSUN4
NSUN5
NSUN6
NSUN7
DNMT1
DNMT3A
DNMT3B
TRDMT1
TET2
ALYREF
别看这是一篇中文paper,里面的分析方法也是一个比较典型的与科研热点基因集结合的纯生信文章的套路。麻雀虽小五脏俱全,作为初学者还是值得好好学习的。