ATAC文库构建通常借助Illumina的Nextera®（Illumina）试剂盒，然而Nextera文库涉及的序列不同于其他形式的文库。
ATAC试验的模式图
Tn5切割连接接头序列
一、Tn5转座酶切割开放DNA
Tn5转座子切割相同的DNA片段并在片段两端添加如下序列，其中加粗斜体部分紧挨着文库的插入片段序列
序列如下:
5’ TCGTCGGCAGCGTCAGATGTGTATAAGAGACAG
Read 1 ——>
5’ GTCTCGTGGGCTCGGAGATGTGTATAAGAGACAG
Read 2 ——>
可以发现Read1、Read2部分序列一致： AGATGTGTATAAGAGACAG
二、随后PCR扩增连接P5、P7接头
连接测序接头以锚定在flowcell芯片上的接头以供测序反应：
序列如下：
5’ AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACAC[i5]TCGTCGGCAGCGTC
5’ CAAGCAGAAGACGGCATACGAGAT[i7]GTCTCGTGGGCTCGG
三、完整文库结构
Index 2 (i5)5’-AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACACIIIIIIIITCGTCGGCAGCGTCAGATGTGTATAAGAGACAG-NNNNNN-CTGTCTCTTATACACATCTCCGAGCCCACGAGACIIIIIIIIATCTCGTATGCCGTCTTCTGCTTG-3’ Index 1 (i7)
IIIIIIII: Index 2 (i5), 8 bases IIIIIIII: Index 1 (i7), 8 bases -NNNNNN-: 插入序列
四、如何过滤去接头？
如果截去接头序列需要在CTGTCTCTTATACACATCT位置截取，工具可以是cutadapt、trim_galore等类似可以自定义截去接头的软件。
五、参考资料
http://bioinformatics.cvr.ac.uk/blog/illumina-adapter-and-primer-sequences/
http://www.360doc.com/content/17/1218/22/19913717_714335567.shtml
