RBP AS生信流程( 附)软件安装

samtools

尝试了各种方法后,最后用conda install samtools安装成功

Piranha

安装参考http://smithlabresearch.org/software/piranha/

Piranha -help #可以使用

HOMER

参考:http://homer.ucsd.edu/homer/ngs/peakMotifs.html
https://mp.weixin.qq.com/s/a4qAcKE1DoukpLVV_ybobA

#建立名为homer的文件夹并进入
wget http://homer.salk.edu/homer/configureHomer.pl 
perl configureHomer.pl -install  
#加入路径:
echo 'export PATH=/home/sxw/biosofts/homer/bin:$PATH' >>~/.bashrc
source ~/.bashrc
findMotifs.pl#成功,可运行
©著作权归作者所有,转载或内容合作请联系作者
平台声明:文章内容(如有图片或视频亦包括在内)由作者上传并发布,文章内容仅代表作者本人观点,简书系信息发布平台,仅提供信息存储服务。