R语言学习② 分享一些基础的R语言代码

2022.5.26 初版
好久没更新了,最近真的太忙了,说来话长。突然想起更新文章,今天来“水”一篇文章吧,就分享我以前在淘宝店帮别人写R语言作业的时候遇到的三个示例(那时候还不太熟,所以语法方面有一点冗余,但是思路还是够基础学习的)


误入BioInfor的大黄鸭 --一个喜欢把教程写着写着写成科普的本科临床医学生


在R语言初学的过程中,对基础实例的学习是很有必要的,特别是使用R语言进行表格的处理,以及一些简单统计学检验的运用等。


文章篇幅有点短,在此我再说说我自己学习生信的思路吧。
第一阶段:学习R语言,学习简单的生物信息学套路(推荐b站等平台)(TCGA,GEO差异分析,富集分析,ppi网络等)(可以像我一样当初开个淘宝店帮别人改代码)(建议单纯想学点科研基础的人走到这部分即可)
第二阶段:学各种生物信息学套路,推荐简书等平台(WGCNA,ceRNA网络,cox预后模型,单基因,基因家族等),可以尝试复现各种5分生物信息学结合实验文章,做完生信补点细胞表型实验(适合想发3分(可以冲冲5-6分)或者中文核心的)(一般本科生最多走到这个阶段就差不多了)(可以开个微信公众号在上面分享学习经验,也可以说是做笔记)
第三阶段:学习nature及子刊新出的生物信息学方法和包(一般这些好用的包作者都放到了GitHub上),学习Linux和Python(以适应超大数据的处理),这个阶段已经可以做流式分选,细胞谱系示踪等实验了,套路一般都是自己设计的。(这个阶段主要看新颖性,少则发七八分,多则十几分)(本科生没必要走到这个阶段,浪费时间,抓住专业课是最重要的!)
向北大张泽民教授,南方医科大学余光创教授还有可爱的曾健明老师学习致敬!!


本教程就先讲到这啦,百度网盘链接在公号后台回复:基础2,欢迎大家关注支持~大家关注一下我公号:误入BioInfor的大黄鸭

最后编辑于
©著作权归作者所有,转载或内容合作请联系作者
  • 序言:七十年代末,一起剥皮案震惊了整个滨河市,随后出现的几起案子,更是在滨河造成了极大的恐慌,老刑警刘岩,带你破解...
    沈念sama阅读 214,658评论 6 496
  • 序言:滨河连续发生了三起死亡事件,死亡现场离奇诡异,居然都是意外死亡,警方通过查阅死者的电脑和手机,发现死者居然都...
    沈念sama阅读 91,482评论 3 389
  • 文/潘晓璐 我一进店门,熙熙楼的掌柜王于贵愁眉苦脸地迎上来,“玉大人,你说我怎么就摊上这事。” “怎么了?”我有些...
    开封第一讲书人阅读 160,213评论 0 350
  • 文/不坏的土叔 我叫张陵,是天一观的道长。 经常有香客问我,道长,这世上最难降的妖魔是什么? 我笑而不...
    开封第一讲书人阅读 57,395评论 1 288
  • 正文 为了忘掉前任,我火速办了婚礼,结果婚礼上,老公的妹妹穿的比我还像新娘。我一直安慰自己,他们只是感情好,可当我...
    茶点故事阅读 66,487评论 6 386
  • 文/花漫 我一把揭开白布。 她就那样静静地躺着,像睡着了一般。 火红的嫁衣衬着肌肤如雪。 梳的纹丝不乱的头发上,一...
    开封第一讲书人阅读 50,523评论 1 293
  • 那天,我揣着相机与录音,去河边找鬼。 笑死,一个胖子当着我的面吹牛,可吹牛的内容都是我干的。 我是一名探鬼主播,决...
    沈念sama阅读 39,525评论 3 414
  • 文/苍兰香墨 我猛地睁开眼,长吁一口气:“原来是场噩梦啊……” “哼!你这毒妇竟也来了?” 一声冷哼从身侧响起,我...
    开封第一讲书人阅读 38,300评论 0 270
  • 序言:老挝万荣一对情侣失踪,失踪者是张志新(化名)和其女友刘颖,没想到半个月后,有当地人在树林里发现了一具尸体,经...
    沈念sama阅读 44,753评论 1 307
  • 正文 独居荒郊野岭守林人离奇死亡,尸身上长有42处带血的脓包…… 初始之章·张勋 以下内容为张勋视角 年9月15日...
    茶点故事阅读 37,048评论 2 330
  • 正文 我和宋清朗相恋三年,在试婚纱的时候发现自己被绿了。 大学时的朋友给我发了我未婚夫和他白月光在一起吃饭的照片。...
    茶点故事阅读 39,223评论 1 343
  • 序言:一个原本活蹦乱跳的男人离奇死亡,死状恐怖,灵堂内的尸体忽然破棺而出,到底是诈尸还是另有隐情,我是刑警宁泽,带...
    沈念sama阅读 34,905评论 5 338
  • 正文 年R本政府宣布,位于F岛的核电站,受9级特大地震影响,放射性物质发生泄漏。R本人自食恶果不足惜,却给世界环境...
    茶点故事阅读 40,541评论 3 322
  • 文/蒙蒙 一、第九天 我趴在偏房一处隐蔽的房顶上张望。 院中可真热闹,春花似锦、人声如沸。这庄子的主人今日做“春日...
    开封第一讲书人阅读 31,168评论 0 21
  • 文/苍兰香墨 我抬头看了看天上的太阳。三九已至,却和暖如春,着一层夹袄步出监牢的瞬间,已是汗流浃背。 一阵脚步声响...
    开封第一讲书人阅读 32,417评论 1 268
  • 我被黑心中介骗来泰国打工, 没想到刚下飞机就差点儿被人妖公主榨干…… 1. 我叫王不留,地道东北人。 一个月前我还...
    沈念sama阅读 47,094评论 2 365
  • 正文 我出身青楼,却偏偏与公主长得像,于是被迫代替她去往敌国和亲。 传闻我的和亲对象是个残疾皇子,可洞房花烛夜当晚...
    茶点故事阅读 44,088评论 2 352

推荐阅读更多精彩内容