2022.5.26 初版
好久没更新了,最近真的太忙了,说来话长。突然想起更新文章,今天来“水”一篇文章吧,就分享我以前在淘宝店帮别人写R语言作业的时候遇到的三个示例(那时候还不太熟,所以语法方面有一点冗余,但是思路还是够基础学习的)
误入BioInfor的大黄鸭 --一个喜欢把教程写着写着写成科普的本科临床医学生
在R语言初学的过程中,对基础实例的学习是很有必要的,特别是使用R语言进行表格的处理,以及一些简单统计学检验的运用等。
文章篇幅有点短,在此我再说说我自己学习生信的思路吧。
第一阶段:学习R语言,学习简单的生物信息学套路(推荐b站等平台)(TCGA,GEO差异分析,富集分析,ppi网络等)(可以像我一样当初开个淘宝店帮别人改代码)(建议单纯想学点科研基础的人走到这部分即可)
第二阶段:学各种生物信息学套路,推荐简书等平台(WGCNA,ceRNA网络,cox预后模型,单基因,基因家族等),可以尝试复现各种5分生物信息学结合实验文章,做完生信补点细胞表型实验(适合想发3分(可以冲冲5-6分)或者中文核心的)(一般本科生最多走到这个阶段就差不多了)(可以开个微信公众号在上面分享学习经验,也可以说是做笔记)
第三阶段:学习nature及子刊新出的生物信息学方法和包(一般这些好用的包作者都放到了GitHub上),学习Linux和Python(以适应超大数据的处理),这个阶段已经可以做流式分选,细胞谱系示踪等实验了,套路一般都是自己设计的。(这个阶段主要看新颖性,少则发七八分,多则十几分)(本科生没必要走到这个阶段,浪费时间,抓住专业课是最重要的!)
向北大张泽民教授,南方医科大学余光创教授还有可爱的曾健明老师学习致敬!!
本教程就先讲到这啦,百度网盘链接在公号后台回复:基础2,欢迎大家关注支持~大家关注一下我公号:误入BioInfor的大黄鸭