多数的作者在进行论文写作时，鲜少注意到写作正进行到哪个阶段，因而常感到不知所措。我们可以将写作流程细分为九个阶段，并遵循着每个步骤，从而掌握写作进度及要领，顺利写出一篇优秀的学术论文。
1、思考论文雏形
在正式开始之前，花5到10分钟来沉淀心灵吧！写下任何盘旋在您脑海中的事情，无论是需要完成的差事或是所担心的事，而呈现方式则随个人喜好，条列式、树状式、或日记型式都可以（写日记可以帮助人们理解自己脑袋在想什么）。无论如何，在开始写作前先把脑袋净空；在开始写作后也可以将笔记本放在旁边，随时写下那些出现脑海里零零散散的想法。
2、查询资料并且做笔记
不要只是阅读资料，要主动且专注地做笔记。
3、脑力激荡与构思
您不一定会需要这个阶段。假设您已经做好文献探讨并整理好手中的笔记，那您应该十分清楚自己想论述的各个论点，接下来要做的只是将各部份的笔记组合成一篇文章。有时候我们会遇到难题而被卡住，或是在一个段落里要结合很多不同的想法，这时就需要其他方法来帮助我们澄清思绪、架构文章。
4、以心智图构思架构
以心智图的方式呈现脑力激荡所得到的结果，藉此整合想法并建立文章架构。心智图法为Tony Buzan于1970年代所提出的一种辅助思考的工具，Buzan强调图上的每一个主题都存在着关联性，由一个中心主题出发，在延长线上衍生更多新的想法。心智图能刺激您的思考，藉此激发更多想法，并帮助您厘清复杂的概念。
5、整合心智图并开始安排段落架构
在完成资料搜集和脑力激荡后，便可以开始写下一些简短的文字，这些文字就像会议摘要一样，为一篇论文的基本架构。在参考过许多不同的方法后，我们选出七个重点做为文章架构基础。在您开始撰写文章或其中一个章节前，请先浏览以下七点并各写下一个句子。
6、在简述中加入想法，并填入段落架构
如果手边有已经整理过的笔记，请直接将它们合并成一个新的档案，并尽快将每个笔记间不足的地方填补起来。若先前没有留下任何笔记，则尽可能地一次写下所有想说的论点。
7、开始进行写作
前面一个阶段可被视为thinking writing 阶段，接下来则是doing writing 阶段。在经过前面几个阶段后，您已经成功写下脑中的想法，也看过一遍，在这当中找到可以被论述的论点，手边也有足够的资料来发展、铺陈，接着便是时候改变写作型态了。在此阶段，写作不再是为了帮助思考，而是用来向读者展示、论述或证明您的想法及观点。
8、自我检视与检讨
在批判阶段，您开始审阅、编辑前面写好的文章内容。假设您在没有过度思考的前提下写出了大量文字，现在该做的便是提出问题，并依答案精简您写好的文章，使其更具条理及连贯性。此阶段您可以尽可能的挑剔，大胆删去不相干的内容，使段落与段落间更加紧密。
9、精简与合并舍去冗赘文字
Killing your darlings被用来指称编辑时最残忍的部分，意即删除您很喜欢、但却没有实际贡献的文字。Darlings指的是过于累赘、或是因为作者个人偏好而出现的句子或段落。在小说中，这可能是指某个角色、或是一些优美但却对故事发展没有帮助的文句。在学术写作中则是指离题的段落／句子，或是某个很吸引您但却扭曲文章论点的部分
