先看例子:
value <- list(1, 2, 3, 'a', 5)
lapply(value, FUN = function(x){
return(class(x))
})
可以看到这个列表里面元素的数据类型分别为:
[[1]]
[1] "numeric"
[[2]]
[1] "numeric"
[[3]]
[1] "numeric"
[[4]]
[1] "character"
[[5]]
[1] "numeric"
现在我们想求这个列表里面所有对象的对数值,代码:
log <- vector()
for (i in 1:5){
log[i] = log(value[[i]])
}
最后运行出来的log向量为:
cat(log)
## 0 0.6931472 1.098612
可以看到log向量只有3个数值,原因在于当我们在执行这个循环的时候,有一次循环出现了错误(不能对字符串进行数学运算),导致了整个循环的提前终止,所以出现了这样的结果。但有的时候,我们希望循环不会受到某次循环错误的影响而提前终止,要继续运行下去,这就是如何优雅处理R循环中的error。
方法一:try()
我们首先来看一下,try()到底在干什么:
cal_log <- function(x){
return(log(x))
}
for (i in 1:5){
temp <- try(cal_log(value[[i]]), silent = T)
print(class(temp))
}
##[1] "numeric"
##[1] "numeric"
##[1] "numeric"
##[1] "try-error"
##[1] "numeric"
实际上我们可以看到循环并没有因为log('a')
而终止(因为第五个类型为numeric),那么我们是不是可以直接这样操作就得到我们的结果呢?
cal_log <- function(x){
return(log(x))
}
log <- vector()
for (i in 1:5){
log[i] <- try(cal_log(value[[i]]), silent = T)
}
print(log)
##[1] "0"
##[2] "0.693147180559945"
##[3] "1.09861228866811"
##[4] "Error in log(x) : non-numeric argument to mathematical function\n"
##[5] "1.6094379124341"
结果是不符合我们预期的,把原本的数值转换成了字符,所以我们可能需要把try()
的输出个性化一下:注意到当运行出现error时,try()
返回的对象类是特殊的"try-error"
,所以我们可以这样来操作一下:
cal_log <- function(x){
return(log(x))
}
log <- vector()
for (i in 1:5){
temp <- try(cal_log(value[[i]]), silent = T)
log[i] <- ifelse(class(temp) == "try-error", NA, temp)
}
print(log)
##[1] 0.0000000 0.6931472 1.0986123 NA 1.6094379
方法二:tryCatch()
tryCatch()
函数对于我们大多数人来说,掌握下面的结构基本就够我们处理错误信息了:
tryCatch({
<expr_1>
}, error = function(e){
<expr_2> #当出现error时就运行这句
}, warning = function(w){
<expr_3> #当出现warning时就运行这句
}, finally = {
<expr_4> #每次循环必运行,无论前面正常与否
})
那么我们可以把上面的操作用tryCatch()
实现一下:
cal_log <- function(x){
return(log(x))
}
log <- vector()
for (i in 1:5){
tryCatch({
log[i] = cal_log(value[[i]])
}, error = function(e){
log[i] = NA
print('Encounter an error!')
})
}
##[1] "Encounter an error!"
print(log)
##[1] 0.0000000 0.6931472 1.0986123 NA 1.6094379
这个时候,当循环运行到log("a")
时,就会自动运行log[i] = NA
,同时打印出提示信息:print('Encounter an error!')
。
以上就是两种R中处理循环error的方法!