解立军遇害且被沉入水井，起初警方以为凶手是当晚与他一起下棋的赵大爷。岂料他大喊冤枉，之后警方又继续调查，仅凭死者嫂子的一句话揪出真凶。

一大早，赵大爷到水井挑水，发现水井被树枝填满，很是气愤。他边大骂边打捞树枝，不一会，他发现一条腿急忙报警。

接到报案，法医秦明带着三人组来到现场，发现水井不远处有一堆与井里一样的树枝。很快尸体打捞上来了，是一具男尸。由于井水凉，秦明还不能判断死者死亡时间，他查看了尸斑，估计死者的死亡时间在二十四小时以上，四十八小时以内。而且死者的面部被衬衫包裹，颈部套着草绳，背部有好几处伤痕。这些伤痕没有生体反应，初步推断是他杀。大宝认为附近都居住着村民，凶手行凶抛尸的时间一定是晚上。

当秦明解开死者脸上的衬衫时，赵大爷确定地对秦明说死者是本村的解立军。他还带着警察三人到解立军家，出发时警察看了表，走到解立军家走了十分钟，大约八百米的路程。

进了屋，地板上有大量的烟头及酒瓶，这些都得带回去做DNA检测。举目望去，死者的床上很乱，床下摆放着拖鞋，看样子极可能是在睡着时遇害的。大宝还发现桌子上还原封不动地摆着没下完的象棋，红方只差一步就要胜利了。

屋内的地上还有一道拖痕，那痕迹从床尾一直到门口才消失不见。由此推测，凶手是单人行动，行凶后把死者拖到门口，再用交通工具运走。

因为山村局里警局太远，只能原地做个临时解剖室。秦明看了看死者，他的眼睑密布出血点icon，手指及脚趾甲呈现乌黑，口腔黏膜有大量局限性出血，这些都是窒息而死的特征。死者的颈部还有有很深的勒痕，没有生体反应，估计是被沉井所致。至于脸上包裹的衬衫，极有可能是恐惧或害羞。

此时，细心的大宝发现，套在死者脖子上的草绳被重物拉断了，他猜测井底一定还有东西没打捞上来。秦明让李涛了解死者的家庭背景，他与大宝开始解剖尸体发现，死者的胃部是空的，这就说明死者在吃饭六小时后被杀害。

另一边，林涛基本摸清死者的情况。死者解立军今年41岁，还单身。他有一个哥哥叫解立国，兄弟俩感情很好，这些年来哥哥总给弟弟送饭。他遇害那晚是嫂子给他送饭。当时看见他在摆弄象棋，说有人要来下象棋。次日早上,嫂子再来给解立军送饭，发现他已不在家。因为他曾说这段时间要出趟远门，嫂子当时也没多想。

这时，解立军家地板上烟头检测出来了，让警员感到意外的是，就是报案的赵大爷在案发当晚与死者下棋。可他却只字不提。秦明马上带着警员返回解立军家观察，从发现烟头的位置来看，当时赵大爷行黑方棋，而谢立军行红方棋。很有可能两人赌贵重物品，输了的老赵不甘心，趁解立军熟睡时将他杀死。从拖尸的痕迹中有很多空白也能看出，行凶者力气小，歇了好几次才把尸体拖到门口。

于是，秦明马上提审赵大爷。他大喊冤枉，承认当晚与解立军下棋，但十点半就回家睡觉了。秦明看他说得面不改色，也觉得他不是凶手。

这时，林涛把井底的东西打捞上来了，是一薄膜袋的碎石。他调查过了，距离水井三百米外一家在建房子有这样的碎石。大宝发现装满碎石的薄膜袋被砸了很多小孔。

本来大宝对薄膜袋被砸孔很迷惑，当晚梦见小时候跟着爸爸买豆腐，卖主总会在袋子上砸孔，由此推断那袋子表明凶手近期买过豆腐。而秦明看着井边的细碎的干柴没有一点掉落在地上，便猜测凶手用三轮车运干柴及尸体。

果不其然，秦明发现在通往水井拐弯出处有车轮印。于是对买过豆腐及家有三轮车的进行排除。结果近期买过豆腐的有三十二人，其中这两天买过豆腐的有十一人，这十一人中有三轮车的七人，但车轮印与路上留下的不吻合。秦明想了想让警员排除没有三轮车的四人，其中有一人是解立国。

由于警察去排除时，曾偷偷拍买过豆腐村民的房屋照片，所以秦明从相片中发现解立国家的庭院有三轮车把手，便让林涛与大宝去借三轮车。解立国直接说没有三轮车，不料他妻子恰巧走出来，警察又开口问她妻子借三轮车，他妻子爽快地答应了，还问他为什么把三轮车开出去不开回来。

妻子的话让解立国露馅了，他老实交代自己杀死弟弟并把三轮车埋在后院这事。原来，解立国家里穷，到了试婚年龄他娶了妻子，弟弟却成了光棍。可妻子生孩子时，弟弟比他这个做父亲的还紧张，当时他心里直犯嘀咕。

那天，解立国的妻子带着儿子给弟弟送饭，解立国偷偷跟过去。弟弟让解立国儿子喊他爸爸，还说过几天就带他们母子俩到外地生活。解立国生气极了，当晚睡不着出去溜达，来到弟弟家趁他睡着骑在他身上将他捂死。之后看见弟弟死不瞑目急忙用衬衫抱住脸，然后回家起来三轮车，把弟弟的尸体沉入井底。

当秦明把埋在后院的三轮车挖出来后，车轮果然与路上留下的痕迹一样。解立国被逮捕，他将受到法律的严惩。

这是悬疑片《法医秦明》的故事情节，解立军因为给哥哥戴绿帽子，气得哥哥狠下毒手将他杀害抛尸井底。很显然，解立军给哥哥戴绿帽子是有悖伦理的，要是他与嫂子真心相爱，就应该劝嫂子离婚再明媒正娶。