The microbiome quality control project: baseline study design and future directions - PubMed
微生物组研究在过去几年中迅速增长，但各项研究之间的重现性一直很困难。来自不同实验室的测量之间的相关变异尚未得到系统评估，这种变异源自多种因素。同时，科学界对于生物医学研究缺乏可重现性的担忧也在日益加剧。微生物组质量控制项目（MBQC）应运而生，旨在识别微生物组研究中的变异来源，量化这些变异的幅度，并评估不同正负对照策略的设计和实用性。
为了使人类微生物组研究转化为对健康有实际意义的成果，需要对来自人口规模队列的可重现数据进行荟萃分析。实现微生物组研究的足够可重现性一直是一个挑战。我们报告了微生物组质量控制（MBQC）项目基线研究（MBQC-base）中分类学剖析的变异性基线调查。来自人类粪便、化学反应器和人工微生物群落的盲样集经过15个实验室的测序，并使用九种生物信息学协议进行分析。变异性主要依赖于生物样本类型和来源，其次是DNA提取、样本处理环境和生物信息学分析。对人工群落样本的分析揭示了提取效率和生物信息学分类的差异。
