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@LYL_2488 我最后换软件了唉~ 这个最终我还是没法解决
GWAS 学习之admixture背景 群体遗传学中测出很多个个体，得到了最终的SNP vcf文件，需要将其分成群体，看哪几个物种聚在一起。一般使用的软件就是STRUCTURE，但是STREUTURE运行速度...
谢谢版主 受教了！
如何计算效应值（例如育种值）的准确性（accuracy）？准确性指的是预测效应值与真值之间的相关系数。有时还会遇见一个概念——可靠性（reliability）。可靠性是准确性的平方，也就是说这二者度量的是一个事情。reliabili...
博主 请问您用过ipat吗？我是windows用户，我在使用的时候已经按照要求全部安装了所需的包，也检查的所有的包都可以调用 但是进行BGLR分析的时候 使用开发者的demo进行操作 界面是空白的 什么都不显示 请问是哪里出问题了？？
Chen2018开发了一个带界面的GWAS和GS操作软件Chen CJ, Zhang Z. iPat: Intelligent Prediction and Association Tool for Genomic Researc...
请问大神 我每次运行都出现这个 Segmentation fault (core dumped 请问是什么情况？
GWAS 学习之admixture背景 群体遗传学中测出很多个个体，得到了最终的SNP vcf文件，需要将其分成群体，看哪几个物种聚在一起。一般使用的软件就是STRUCTURE，但是STREUTURE运行速度...
@紫竹林_b67e 请问你最后解决了吗？？
Plink文件格式介绍（一）introduction Plink算是生物信息最常用的软件之一了，而且很多软件的输入也会使用Plink的文件格式。这次我们来一起认识一下Plink中最常用的两种格式，.pe...
@橙子牛奶糖 谢谢大佬了~
GWAS:网页版的基因型填充（genotype imputation）在全基因组关联分析中，处理芯片数据时，必须走的一个流程就是基因型数据填充（imputation）。 当然，如果你拿到的是全测序的数据，请忽略这一步。 下面直奔主题，怎么在网页...
博主请问用 vcftools 取2个不同测序文件的SNP交集呢？？十分感谢！
关于SNP的过滤（1）：如何使用vcftools进行SNP过滤前言 很多关注我这个专题的朋友都在后台留言，说想了解更多关于SNP过滤的东西。是的，确实这是一个比较重要的问题。第一，过滤到一些低质量的SNP可以防止calling一些假阳性...
请问大佬这个网站可以填充动物的吗?
GWAS:网页版的基因型填充（genotype imputation）在全基因组关联分析中，处理芯片数据时，必须走的一个流程就是基因型数据填充（imputation）。 当然，如果你拿到的是全测序的数据，请忽略这一步。 下面直奔主题，怎么在网页...
