一、前言 左边的图简单地把多个单细胞的数据合并在一起,不考虑去除批次效应,样本之间有明显的分离现象。右边的图是使用算法校正批次效应,不同的样本基本融和在一起了。scRNA数据...
在转录调控相关的文献中,我们经常能够看到这样的蛋白质相互作用网络(protein protein interaction network,PPI network)。具体而言,...
关于相关性,表示数据之间的相互依赖关系。但需要注意,数据具有相关性不一定意味着具有因果关系。 相关性在组学数据挖掘中应用非常广,如样本的重复检验、基因的共表达分析、微生物群落...
----前不久拿到公司给的转录组测序结果,Gene ID是以ENMUST开头,查了一下,ENST为EMBL 核酸数据库中人类的转录本ID,ENMUST为鼠的转录本ID。一般我...
常用数据库 ID 序号ID 示例ID 来源一GLA, GLB, UGT1A1HGNC Gene Symbol(基因的官方名称)二ENSG00000116717Ensemble...
欢迎关注公众号“生信小课堂” TCGA数据分析课程:生物信息学教学 今天继续我们TCGA在线数据库系列。今天介绍的数据库是LinkedOmic,http://www.link...
对于基因芯片Array测序数据,基因是与探针(probe)存在对应关系,而不同平台(platform)的探针与基因对应关系都是不同的。因此在挖掘GEO里的array数据时,需...
1.kegg数据库下载 通常我们如果已知某个基因,想对这个基因做通路很简单,直接用kegg的网页注释就可以;如果想知道某个通路里相关的所有基因列表,要找全的话只能从数据库里调...