zhaoqianyi

请问matirx结果是hicpro产生的吗

【三维基因组】TAD分析软件—InsulationScore

Insulation Score是由dekker实验室开发的，软件路径（https://github.com/dekkerlab/cworld-dekker） 分析原理 总结...

XuningFan

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zhaoqianyi

@caokai001 请问第四列是什么内容，我不知道你的gene.bed是什么内容，希望能解答，谢谢

AB区室计算【juicer/homer】

Tips： 目前主流的计算AB区室工具: juicer/homer/cworld juicer: 第一篇HiC文章实验室提供的工具,计算多个分辨率每个bin的PC1 值，但是...

caokai001

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zhaoqianyi

请问GCF_000003025.5_Sscrofa10.2_genomic.gene.bed是直接从NCBI上下载的吗，怎么第六列不是+

AB区室计算【juicer/homer】

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caokai001

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zhaoqianyi

请问hic文件是依据merged_nodup.txt文件生成的吗

Juicer:Hi-C数据处理分析（一）

参考： [1]. Durand, N.C., et al., Juicer Provides a One-Click System for Analyzing Loop...

上校的猫

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