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在R语言中运行Cibersort共需要三个文件,分别是(1)官方提供的22种细胞基因集“LM22.txt”;(2)自己的表达矩阵;(3)Cibersort代码。 (1)LM2...
说在前面 Immugent在之前一篇推文中:CBNplot:可视化富集通路中基因的调控关系[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzI4MjY5...
通过前期的分析,我们确定了感兴趣的module,但是module中又含有几十甚至上百的基因,下一步需要进一步筛选hub gene。 WGCNA(3):基因模块与性状关联识别重...
2020年12月7日,来自西湖大学的郑钜圣团队联合中山大学陈裕明团队及南方医科大学周宏伟团队,在Diabetes Care杂志在线发表了题为“Interpretable ma...
RNA缩略词详解 lncRNA:长链非编码RNA(long non-coding RNA) miRNA:微小RNA(microRNA) circRNA:环状RNA(circu...
在这个信息大爆炸的年代,浩瀚的信息流如同汪洋大海一般,将每个人都紧紧环绕。如何利用已有的工具从中筛选有用信息,对我们每个人,尤其是科研人而言,尤为重要。在免疫学,医学,药学科...
液体活检三大标志物之一的外泌体(exosomes),近几年研究热度持续攀升。2020年初,外泌体领域的顶级专家Raghu Kalluri和Valerie S. LeBleu在...