head(fpkms[1:3,1:3]), 😂我还楞了一下,这head似不似有点多余
count转fpkm,tpm完整版参考资料:1.如何把从TCGA下载的HTseq count转换成FPKM - 简书 (jianshu.com)[//www.greatytc.com/p/4afbd...
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老师,您是咋确认接头序列是什么,我不知道 cutadapt --bwa -a 啥,网上找的17年的数据,阿里卡多
遇到了一次colorspace的测序数据目前已经是我接触生物信息学的第四年了,这里的内容由于学业压力也很久没有更新,现在可以趁着寒假的空闲时间写一写最近遇到的东西。我通常处理的都是RNA-seq数据,也全是来自il...
我始终觉得,喜欢是需要表达出来的。第六感也很重要。如果第六感并没有察觉到他对你的喜欢,那他可能是真的不喜欢你。还有什么是爱?爱是随时想到他就想联系他,有什么事情都想要和他分享...
我:小爱同学小爱同学:欸!我:什么是爱情?小爱同学:① 爱情是裹着眼泪的蜜饯② 就是两个人互相的爱③ 爱情不是轰轰烈烈的誓言,而是平平淡淡的陪伴
轨迹分析系列: 单细胞之轨迹分析-1:RNA velocity[//www.greatytc.com/p/ee0f7a8e6a06] 拟时间序列分析(Pseudot...
学霸姐姐 yyds
单细胞之轨迹分析-2:monocle2 原理解读+实操轨迹分析系列: 单细胞之轨迹分析-1:RNA velocity[//www.greatytc.com/p/ee0f7a8e6a06] 拟时间序列分析(Pseudot...
常用的细胞通讯软件:CellphoneDB[//www.greatytc.com/p/38a9376f5286]:是公开的人工校正的,储存受体、配体以及两种相互作用...
练习数据集的GEO编号:GSE139324 (Immune Landscape of Viral- and Carcinogen-Driven Head and Neck C...
18年发的,文章比较早了,但是是第一篇小鼠心脏非心肌细胞图谱,很多综述里都提到了这一篇,意义还是比较大的。 HighlightsComprehensive transcrip...
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编程对象简介 R虽然有S3、S4、(RC)Reference classes 三个面向对象的系统和一个多由C语言构建的基本类型(base types),但是一般S3就能够满足...
GSEA简介 基因集富集分析(GSEA)是一种计算方法,可确定先验定义的基因集是否在统计上显示两种生物学状态之间存在显着一致的差异。来自官网:GSEA[https://www...
陈巍学基因:http://www.iqiyi.com/w_19rvim699t.html,这好像是QQ飞车的链接哈哈哈
走进单细胞10X genomics了解什么是UMI,什么是barcode,再做分析之前,知道他们是在测序中引入,了解为什么引入即可。 看个简介的视频吧 从了解10X genomics开始陈巍学基因:http:...
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向量空间 向量空间的概念 向量空间表示一整个空间的向量,然而,这并不意味着任意向量的集合就能被称为向量空间。所谓向量空间,必须满足空间对线性运算封闭(也即是相加和数乘)这一原...