发简信
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作者：童蒙编辑：angelica 前言 序列比对在生物信息中很常见，通过比较序列的相似度来推测其相关的功能。序列比对一般针对的是两条或者多条序列，可以是DNA、RNA或者蛋白...
ChatGPT是一款基于聊天场景的大模型AI，最近火出圈。 Chat表示聊天，GPT表示大模型算法，它通过生成式的人机对话功能，让使用者第一次有了AI机器人‘懂我‘的感觉，而...
某一天，我生成了2个箱图boxplot，突然间老师要求合并成1个箱图，唉～～～于是我各种查资料，学着做这种分组plot，结果如上图所示，主要想用多组boxplot展示同组数据...
使用《OncoImmunology》一篇paper中的数据进行实战 数据获取地址：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJEB3...
前言 这是《How the immune system works 6th》（中文名是《免疫学概览》）读书笔记的第3篇，主要内容是抗原呈递。 什么是MHC 在上一篇笔记中我们...
昨天老师发给我一篇生信女神Shirley Liu的文章，看了里面的内容之后感觉很兴奋～它可以不做免疫组测序，直接从Bulk RNA-seq或者scRNA-seq里面重构得到免...
immune repertoire sequencing data (RepSeq data)免疫组库数据 vdjtools 分析流程: vdjtools 目前版本是1.2....
想了解ID转换的ID类型，打开ncbi，类型下拉选择gene，搜索tp53，随便进入一个，如https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/7157[ht...
摘要：不同的测序平台或同一平台不同样本得到的测序数据需要去除批次效应后进行整合分析，拟采用Seurat2程序包对CelSeq，CelSeq2，Fluidigm C1，SMAR...
参考：https://cran.r-project.org/web/packages/data.table/data.table.pdf 描述 "freda" 用于常规分隔文...
基因使用计算 immunarch包带有一个基因片段数据表，其中包含了遵循IMGT[http://www.imgt.org/IMGTrepertoire/LocusGenes/...
