如何查找某个gene的promoter sequence？ 首先，知道启动子在哪里？启动子通常位于转录起始位点（transcription start site，TSS）或第...
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如何查找某个gene的promoter sequence？ 首先，知道启动子在哪里？启动子通常位于转录起始位点（transcription start site，TSS）或第...
An overview of ChIP–seq, DNase-seq, ATAC-seq, MNase-seq and FAIRE–seq experiments. 看到六六...
转录因子主要有3种作用方式调控基因表达：TF既可以结合在DNA临近的增强子也可以结合在启动子玉玉。和TF有关的基因转录既可以上调也可以下调，TF通过以下几个方面调控基因表达，...
TF: transcription factor转录因子TFBS: transcription factor binding site转录因子结合位点TFBS是序列内的loc...
转录因子是通过结合特异性DNA序列控制遗传信息从DNA到信使RNA的转录速率的蛋白，转录一男子可通过修饰（甲基化、去甲基化、乙酰化、去乙酰化等修饰）与启动子进行互作结合调控，...
TRANSFAC 数据库 有两个版本，公开版和专业版 JASPAR数据库 JASPAR是收集有关转录因子与DNA结合位点模体的最全面的公开的数据库，该数据库众所包含的数据都经...
欢迎关注”生信修炼手册”! ENCODE数据库中包含了许多转录因子的chip-seq数据，通过对chip-seq数据进行分析，可以预测得到该转录因子对应的靶基因数据。 通过整...
做完转录组分析完之后，一般会找到一些差异表达的基因。差异表达基因中如果有转录因子的话，可以研究一下转录因子调控哪些基因的表达。要预测转录因子调控的靶基因，需要两个步骤： 1....
序列比对和序列特征分析总目录 启动子Promoter是位于基因5'端上游的DNA序列，调控基因表达。作用方式是通过与转录因子结合。关于启动子更详细的简文请看查找一个基因的启动...
上传DEGs gene_list到String 调整分析参数 然后下载tsv文件 同时下载图片 将前两列导入到cytoscape 导入到cytoscape 通过MCODE分析...
