@土雕艺术家 非常感谢，我知道了。
PartitionFinder2的Lunix安装与使用 2021-07-23PartitionFinder官网http://www.robertlanfear.com/partitionfinder/[http://www.robertlanfear...
发简信
IP属地：河南
@土雕艺术家 非常感谢，我知道了。
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请问data_blocks怎么分区？
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mafft之后不需要去掉比对中的gap (TrimAl)吗？我看其他文章都有写
mafft+iqtree构建进化树mafft可以用来进行快速的序列比对，因为其可以设置多线程。具体的命令行如下： 接下来等着运算完就可以使用iqtree来建树了，具体命令行如下： -b指代的是bootstra...
@八段锦1134 Thanks♪(･ω･)ﾉ
2021-03-30香荚兰1停了2天，没写文献阅读体会，因为感觉乱糟糟的，需要好好整理一下：1、每天没有留够足够的时间来看文献，哪怕一小时，也是全部看文献的1小时。2、宜早不宜迟，不是说晚上1小时看文献...
请问该文献连接能发一下吗
2021-03-30香荚兰1停了2天，没写文献阅读体会，因为感觉乱糟糟的，需要好好整理一下：1、每天没有留够足够的时间来看文献，哪怕一小时，也是全部看文献的1小时。2、宜早不宜迟，不是说晚上1小时看文献...
@曾庆东_cd95 请问解决了嘛？我的数据明明写的双端，是拆开就是只有一个fq文件。。
都8102年了，还用fastq-dump，快换fasterq-dump吧之前写过一篇文章Fastq-dump: 一个神奇的软件[//www.greatytc.com/p/a8d70b66794c]， 详细介绍了fastq-dump的用法...
我也是这样，该怎么办呀
R-问题集合-如何安装gpclib问题 安装gpclib时提示： Package which is only available in source form, and may need compilatio...
@Jiao_35aa 会不会是这个文章，因为我看他class code是这里找的，文章我还没看。Transcript-level expression analysis of RNA-seq experiments with HISAT, StringTie and Ballgown
gffcompare的使用说明参考文献：Transcript-level expression analysis of RNA-seq experiments with HISAT, StringTie ...
请问我用AStalavista软件得到的结果一个是gtf，但是他说这是二进制文件，我打开之后没有内容，这是为什么？
全长转录本结构分析（下）作者：Arno审稿：童蒙编辑：angelica 前面我们介绍了PacBio三代全长转录组测序相关的全长转录本鉴定、全长转录本比对、全长转录本结构分析上篇。 今天我们继续介绍包...
单端测序和双端测序 单端测序只有一种测序引物 ，使得PCR只能沿着这个引物的方向进行，所有的 reads 都只能按照一个方向进行读取。但是测序的质量会随着测序的进行而下降，所...
都没有Build.pl
bioperl安装（无需root权限）bioperl安装流程： bioperl 安装（cpan） perl -MCPAN -e shell 一路回车，安装完成后q退出 下载bioperl(wget https:/...
@wo_monic 谢谢你
LTR-RTs的鉴定,LAI值的计算LAI是一种新的评估基因组组装质量的评价标准。LTR讲解[//www.greatytc.com/p/a93cdbc36339]部分转载自https://www.ji...
motif图可以下载pdf或者其他，也可以在前面的界面右键meme.xml/mask.xml，然后tbtools里可视化。
MEME在线网站查找motif步骤小白日记第一天，记录一下自己查找motif的步骤，以便日后忘记了再重学。之前也用过许多软件，都是在要用的时候上网上各种搜索操作步骤，边学边用，只顾获得结果了，从未意识到要将操...
@多啦A梦的时光机_648d 笑死了哈哈哈哈年轻人
基因家族分析四(绘制基因家族motif图)一：搜索其他保守蛋白结构域 需要准备的文件有：NBS蛋白序列，TIR.hmm和RPW8.hmm 二：拟南芥NPS基因家族含有哪些motif 识别motif的软件用meme。 ...
@SCU十一 好的谢谢
LTR_retriever: 一个更加准的LTR整合分析工具背景篇 在植物基因组中，I类转座因子，LTR-RT(LTR retrotransposons)是基因组扩张的主要原因。完整的LTR长度在85~5000 bp之间，下图图A表示...
请问LTR_finder是不是主要搜索的是完整的LTR，如果想找某个基因里包含的LTR，一般情况找不到结果？因为我使用就没有结果，但是染色体或者基因组有结果。RepeatMasker则表示基因里包含很多LTR元件，应该是某个LTR结构？是这样吗
LTR-RTs的鉴定,LAI值的计算LAI是一种新的评估基因组组装质量的评价标准。LTR讲解[//www.greatytc.com/p/a93cdbc36339]部分转载自https://www.ji...
请问解决了嘛😥为什么repeatmasker找的LTR有的长度很短诶
LTR_retriever: 一个更加准的LTR整合分析工具背景篇 在植物基因组中，I类转座因子，LTR-RT(LTR retrotransposons)是基因组扩张的主要原因。完整的LTR长度在85~5000 bp之间，下图图A表示...