比如,我最近在读取一个excel表格,里面的数据是这样的,是代谢物的名称: 如果我直接读取的话 那么在R里就会出现这样的情况图二 上述情况很麻烦...
编写:王采荷 感觉已经很久没有在简书上分享自己的东西了,今天在集合其他大佬的力量终于把“如何用R语言做差异代谢物的kegg富集分析”这个问题给解...
经历过OrthoMCL软件包安装的艰辛(然而,终究也没安装成功),就知道转而用BPGA包是有多么香了。话不多说,来看看BPGA是如何安装且使用的...
整理:王采荷 一、下载同一种属不同species下的微生物16S rDNA 使用NCBI网站:https://www.ncbi.nlm.nih....
整理:dayueban 主要目的是方便日常对测序数据,如编码某个蛋白的基因在物种间序列上的相似性比较。 一、软件下载和安装 blast软件网址:...
编译:王采荷 关于进化树(系统发育进化树,Phylogenetic tree),一般也叫作系统进化树它的用途我这里就不在赘述了。因为远的不说,就...
导读 菌群分类数据的可视化,包括丰度在个体之间以以及组间的一个比较怎么生动形象,一直是我想解决的问题,今天看到一篇文章上面用的是ggplot2包...
由于没有服务器,只能自己捣鼓着用windows的cmd命令行来批量下载一些数据,但是windows下高通量测序数据(如sra)下载体验真的很差,...
编译:大月半 责编:王采荷 2020年初,新型冠状病毒逐渐开始肆虐全球,其传染性和致病力和SARS病毒及MERS病毒相比是有过之而无不及。即便如...