前言 最近进行基因组数据分析，绘制圈图，想做两个基因组的比较分析，通过查询文献，发现棉花基因组圈图在细节方面做的较好，主要就是染色体排布中间对称...

前言 最近分析叶绿体基因组，进行SNP Calling，网上搜到生信药丸[//www.greatytc.com/u/068665394...

一. 简介 利用柱形图展示不同样品中基因表达的整体情况，首先读取基因表达矩阵，再将数据格式转换成row，col，value三列的格式，然后利用g...

1. 热图及分组 2. 热图聚类和排序 绘制热图的时候我们会遇到这样的问题，我们有一组数据（特别是数据比较多的时候），绘制热图后分别对行和列进行...

一. 简介 叶绿体是绿色植物，藻类和蓝细菌进行光合作用的场所，光合作用将水和二氧化碳转变为有机化合物并放出氧气。叶绿体所携带遗传物质DNA，以原...

一. 简介 corrplot包是一个画相关系数图的包，可以用来对基因的表达数据进行分析，分析不同基因间表达的相关性。 二. 实例 1. 数据格式...

一. 简介 MCScanX是由福建农林大学唐海宝老师参与开发的基因组共线性分析软件，发表至今引用数200以上，相关概念和算法参考文献如下： Ta...

一. 简介 在基因组数据分析过程中，我们可以将fastq，fasta，ONT等不同格式的数据mapping到参考基因组上，然后通过IGV进行可视...