rmats是一款比较好的分析可变剪切的分析软件，将rmats分析的结果，利用rmats2sashimiplot绘画出的图也是比较漂亮的， 可变剪切事件： 可变剪切事件可以分为...
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原文来源：Conesa A, Madrigal P, Tarazona S, et al. A survey of best practices for RNA-seq da...
本文首发于我的个人博客[https://www.ikeguang.com/?p=1783] ％>％来自dplyr包的管道函数，我们可以将其理解为车间里的流水线，经过前一步加工...
参考《R语言与bioconductor生物信息学应用》和相关链接 GEO中可获取文件 1.GPL文件（平台信息，获得探针转换数据） 2.单个样本的表达矩阵 3.SOFT文件（...
生存分析中的ROC是怎么来的，ROC是对二分类资料的评价指标，那对于生存资料呢？ 首先我们分析生存资料的特点：（1）包含有结局和时间两个方面的信息。（2）结局资料一般为二分类...
就是从phenotype查，我也遇到跟你一样的情况，应该有100以上的，但确确实实只有十几个，tnbc一筛下来更少，只有几个了，请问你解决了吗
TCGA乳腺癌芯片数据分组为TNBC和NOT TNBC健明老师布置的作业，感觉还是蛮吃力的。这篇会有点凌乱，一点一点来吧。 1、转义符 首先我遇到了一个问题，就是我的变量里的id是‘TCGA-B6-A0X7-01’诸如此类，而我...
superqun 原创于简书 手工目录： Q1:如何在肺癌数据库中选出k-ras突变的病人样本。 1. 使用GDC下载。 在GDC portal页面中选择Exploratio...
