前面,我们仔细学习了Alpha多样性的一些常见指数,今天我们尝试用R来计算这些常用指数。 library(vegan) library(picante) library(re...
ComplexUpset是非常强的Veen图绘制软件包,平时Veen的绘制最多能达到6个相交,而此包对于就是针对6个以及以上的交互所准备的。特此推荐,以下模板可直接套用。 一...
conda conda与anaconda、miniconda的区别: Conda是一个包管理器;Anaconda是一个发行包conda可以理解为一个工具,也是一个可执行命令,...
前言 R语言对于做数据分析的人来说应该很熟悉,这个开源的平台对于分析人员来说也是相当的友好,里面有很多相当好用的函数可供使用,当然还有很多可供使用的第三方R包。我们需要什...
前面我介绍了可视化的一些方法以及机器学习在预测方面的应用,分为分类问题(预测值是离散型)和回归问题(预测值是连续型)(具体见之前的文章)。 从本期开始,我将做一个数据分析类实...
直接上图 当需要可视化WGCNA结果中某些模块与代谢物的相关性,就需要考虑图形的直观与美观,linkET包比较好的满足了这一要求。 输入文件df1 各模块的表达量 df2 各...
在实际研究中,很多时候都需要数据满足正态分布才可以。比如说回归分析,其实做回归分析有一个前提条件即因变量需要满足正态分布性。也比如说方差分析,其有一个潜在的前提假定即因变量Y...
经常碰到老师在文章接收过程中,编辑要求将原始数据上传NCBI,要是没有数据上传经验的不要慌,小编手把手教你如何快速上传数据至NCBI (一)NCBI账号:上传数据必须有自己的...